More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0503 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.18 
 
 		 565 aa  739    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  63.2 
 
 		 565 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.53 
 
 		 565 aa  738    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  63.18 
 
 		 565 aa  739    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  95.2 
 
 		 583 aa  1127    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  65.85 
 
 		 561 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  66.05 
 
 		 595 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.42 
 
 		 567 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.25 
 
 		 567 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  62.84 
 
 		 565 aa  737    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.37 
 
 		 565 aa  738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.25 
 
 		 567 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  65.98 
 
 		 572 aa  751    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.42 
 
 		 567 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.08 
 
 		 570 aa  733    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.25 
 
 		 567 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  66.05 
 
 		 595 aa  757    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  66.05 
 
 		 595 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.36 
 
 		 565 aa  737    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.53 
 
 		 565 aa  735    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.59 
 
 		 563 aa  733    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  100 
 
 		 583 aa  1183    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.53 
 
 		 565 aa  738    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  52.19 
 
 		 603 aa  595  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.91 
 
 		 600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  51.01 
 
 		 592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  49.09 
 
 		 624 aa  548  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.33 
 
 		 608 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.83 
 
 		 613 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.15 
 
 		 611 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.11 
 
 		 619 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.39 
 
 		 592 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.08 
 
 		 613 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.53 
 
 		 613 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.4 
 
 		 604 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.11 
 
 		 619 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.66 
 
 		 610 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.79 
 
 		 619 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.05 
 
 		 602 aa  475  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.11 
 
 		 619 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.9 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.35 
 
 		 609 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.08 
 
 		 610 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.49 
 
 		 607 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.69 
 
 		 631 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.04 
 
 		 628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.07 
 
 		 624 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.87 
 
 		 810 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.91 
 
 		 586 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.48 
 
 		 789 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.59 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  37.93 
 
 		 731 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  40.48 
 
 		 629 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  37.71 
 
 		 649 aa  359  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.77 
 
 		 624 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  37.17 
 
 		 622 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.56 
 
 		 589 aa  349  8e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  38.55 
 
 		 623 aa  348  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  35.78 
 
 		 750 aa  346  8e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.12 
 
 		 626 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  37.22 
 
 		 630 aa  342  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  37.3 
 
 		 603 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  37.65 
 
 		 642 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  35.68 
 
 		 625 aa  333  6e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  37.27 
 
 		 745 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  36.83 
 
 		 623 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  38.08 
 
 		 577 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  38.96 
 
 		 604 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  35.26 
 
 		 586 aa  329  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  34.91 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  36.67 
 
 		 639 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.45 
 
 		 624 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  38.22 
 
 		 608 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  35.37 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.67 
 
 		 606 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  38.65 
 
 		 589 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  38.37 
 
 		 589 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  35.06 
 
 		 623 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.45 
 
 		 752 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  34.55 
 
 		 632 aa  319  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.07 
 
 		 612 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  34.57 
 
 		 618 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  34.83 
 
 		 626 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  33.44 
 
 		 654 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  36.84 
 
 		 605 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.18 
 
 		 616 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.18 
 
 		 616 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  34.89 
 
 		 615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  34.89 
 
 		 615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  34.83 
 
 		 611 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  34.66 
 
 		 611 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  34.88 
 
 		 617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.65 
 
 		 602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  34.04 
 
 		 631 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  34.37 
 
 		 615 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  35.03 
 
 		 614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.06 
 
 		 654 aa  302  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  34.15 
 
 		 577 aa  302  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  34.14 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.29 
 
 		 614 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>