103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0485 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0581  phosphonate metabolism protein PhnM  94.18 
 
 		 378 aa  745    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0485  phosphonate metabolism protein PhnM  100 
 
 		 378 aa  783    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4025  PhnM protein  63.49 
 
 		 378 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3700  phosphonate metabolism protein PhnM  63.49 
 
 		 378 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3566  phosphonate metabolism protein PhnM  62.96 
 
 		 378 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0515  phosphonate metabolism protein PhnM  63.76 
 
 		 378 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  64.46 
 
 		 389 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03967  carbon-phosphorus lyase complex subunit  63.23 
 
 		 378 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3896  phosphonate metabolism protein PhnM  62.96 
 
 		 378 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4336  phosphonate metabolism protein PhnM  63.23 
 
 		 378 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3931  phosphonate metabolism protein PhnM  62.96 
 
 		 378 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4561  phosphonate metabolism protein PhnM  62.96 
 
 		 378 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03927  hypothetical protein  63.23 
 
 		 378 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4649  phosphonate metabolism protein PhnM  62.96 
 
 		 378 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5608  phosphonate metabolism protein PhnM  62.17 
 
 		 378 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0299  phosphonate metabolism protein PhnM  61.38 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1314  phosphonate metabolism protein PhnM  64.02 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  62.96 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2880  phosphonate metabolism protein PhnM  53.05 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2257  amidohydrolase  51.19 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208452  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2565  phosphonate metabolism protein PhnM  51.46 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20430  phosphonate metabolism protein  52.36 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119853  normal  0.758081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1755  phosphonate metabolism protein PhnM  52.09 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0860  PhnM protein  47.62 
 
 		 379 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0853  phosphonate metabolism protein PhnM  47.62 
 
 		 379 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2366  phosphonate metabolism protein PhnM  46.83 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4663  phosphonate metabolism protein PhnM  46.54 
 
 		 379 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4112  phosphonate metabolism protein PhnM  47.61 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  47.61 
 
 		 374 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3661  phosphonate metabolism protein PhnM  49.21 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.902619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2189  phosphonate metabolism protein PhnM  45.5 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.300882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0287  phosphonate metabolism protein PhnM  46.07 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3334  amidohydrolase-like  42.64 
 
 		 388 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  43.34 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3779  phosphonate metabolism protein PhnM  43.8 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.714138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  44.65 
 
 		 380 aa  292  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0139  phosphonate metabolism PhnM  43.65 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  42.86 
 
 		 386 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0826  phosphonate metabolism protein PhnM  43.62 
 
 		 378 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0583622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1037  amidohydrolase  45 
 
 		 380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5946  phosphonate metabolism protein PhnM  43.18 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1310  phosphonate metabolism protein PhnM  43.35 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6092  phosphonate metabolism protein PhnM  42.56 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2185  putative phosphonate metabolism protein PhnM  42.34 
 
 		 377 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377971  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0756  phosphonate metabolism protein PhnM  43.19 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  41.95 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5842  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  42.93 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3695  phosphonate metabolism PhnM  41.47 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3831  phosphonate metabolism PhnM  41.58 
 
 		 384 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.597425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4095  phosphonate metabolism PhnM  42.26 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3850  phosphonate metabolism protein PhnM  43.27 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.739872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4213  phosphonate metabolism protein PhnM  42.71 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1280  phosphonate metabolism PhnM  41.78 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0119955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2908  phosphonate metabolism protein PhnM  44.03 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0322  phosphonate metabolism protein PhnM  42.62 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3351  phosphonate metabolism protein PhnM  42.9 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2853  phosphonate metabolism PhnM  38.89 
 
 		 434 aa  255  8e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3339  phosphonate metabolism protein PhnM  42.9 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2406  alkylphosphonate utilization operon protein PhnM  42.62 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.854839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1183  phosphonate metabolism protein PhnM  42.62 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3305  phosphonate metabolism protein PhnM  42.62 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2592  phosphonate metabolism protein PhnM  42.62 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3883  phosphonate metabolism protein PhnM  39.63 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4774  phosphonate metabolism protein PhnM  40.21 
 
 		 380 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.807086  normal  0.597497 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  38.06 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1931  phosphonate metabolism protein PhnM  35.98 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.042135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2284  phnM protein, putative  35.98 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0628969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0015  amidohydrolase 3  37.8 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0974182 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  33.16 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  32.38 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3506  amidohydrolase  35.13 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  32.88 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  32.89 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1585  phosphonate metabolism protein PhnM  37.5 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0233  amidohydrolase  32.22 
 
 		 452 aa  172  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2290  amidohydrolase-like protein  31.66 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  33.51 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5003  phosphonate metabolism protein PhnM  31.56 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4082  phosphonate metabolism PhnM  35.81 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  31.15 
 
 		 399 aa  165  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  31.15 
 
 		 399 aa  165  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  30.89 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  30.89 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0507  Amidohydrolase 3  32.87 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  32.21 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0494  Amidohydrolase 3  32.4 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3905  Amidohydrolase 3  31.8 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.347183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3856  Amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0770  phosphonate metabolism protein PhnM  31.56 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5860  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  32.51 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3818  phosphonate metabolism PhnM  32.03 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00668671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4184  amidohydrolase:amidohydrolase-like  33.71 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.767243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  30.94 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5867  hypothetical protein  33.97 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  31.59 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0768  amidohydrolase 3  33.98 
 
 		 407 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2157  metal-dependent hydrolase  31.46 
 
 		 589 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4434  phosphonate metabolism PhnM  32.03 
 
 		 396 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0602  amidohydrolase 3  31.69 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3357  alkylphosphonate utilization protein PhnM, putative  30.03 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>