More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0483 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  95.8 
 
 		 262 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  78.57 
 
 		 262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  78.57 
 
 		 263 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  78.57 
 
 		 263 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.87 
 
 		 262 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.77 
 
 		 273 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.38 
 
 		 252 aa  387  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  76.38 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.38 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.38 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.38 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.38 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  76.38 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.79 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.98 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.62 
 
 		 254 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.62 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.46 
 
 		 258 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.5 
 
 		 271 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.15 
 
 		 284 aa  343  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.86 
 
 		 269 aa  343  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.5 
 
 		 271 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.62 
 
 		 258 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.87 
 
 		 258 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 273 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.45 
 
 		 258 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.06 
 
 		 273 aa  334  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.49 
 
 		 265 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.14 
 
 		 257 aa  326  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.89 
 
 		 262 aa  324  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.49 
 
 		 256 aa  322  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.14 
 
 		 257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.45 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.6 
 
 		 266 aa  317  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.85 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.6 
 
 		 272 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.09 
 
 		 263 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.4 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 256 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 256 aa  311  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.2 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.23 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.74 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.82 
 
 		 256 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.82 
 
 		 256 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.82 
 
 		 256 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.82 
 
 		 256 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  64.82 
 
 		 611 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.87 
 
 		 294 aa  293  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.56 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.94 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.94 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  47.86 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  47.86 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  44.89 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  44 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  50.64 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  46.27 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  48.5 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  48.5 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  48.71 
 
 		 276 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  48.71 
 
 		 276 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  47.21 
 
 		 278 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  45.49 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  47.86 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  47.86 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  41.01 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  38.89 
 
 		 583 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  38.65 
 
 		 573 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.31 
 
 		 548 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  37.31 
 
 		 593 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0212  hypothetical protein  34.38 
 
 		 334 aa  168  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0203  hypothetical protein  34.38 
 
 		 334 aa  168  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.15 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  35.96 
 
 		 612 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0783  ABC transporter related  41.06 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.806728 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.76 
 
 		 568 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  36.64 
 
 		 575 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  35.88 
 
 		 543 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  35.98 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.5 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  35.36 
 
 		 539 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 		 333 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.22 
 
 		 643 aa  165  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.86 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  37.22 
 
 		 627 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.72 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  38.1 
 
 		 629 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 		 548 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>