232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0476 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  100 
 
 		 310 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  96.13 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  56.51 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  56.51 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  53.22 
 
 		 433 aa  329  4e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  52.9 
 
 		 437 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  35.31 
 
 		 561 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.31 
 
 		 561 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.31 
 
 		 561 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.31 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.62 
 
 		 562 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 562 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  34.27 
 
 		 564 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.27 
 
 		 568 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.31 
 
 		 581 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  35.31 
 
 		 578 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.45 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 556 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  35.89 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.28 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  31.58 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.47 
 
 		 545 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  32.52 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.36 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  30.48 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.7 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  28.77 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  30.45 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  28.04 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  28.77 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  27.8 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  27.14 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  26.32 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  28.33 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  27.53 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  26.69 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  26.96 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  27.7 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  27.21 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  26.33 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  25.35 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  25.35 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  29.55 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  25.96 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  25 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  28.62 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  27.7 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  26.01 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  28.41 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.9 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  26.52 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  25 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  24.38 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  26.49 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1533  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.28 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  24.38 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2000  2-methylisocitrate lyase  25.76 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440629  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  24.38 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  29.76 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  24.38 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  24.38 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  27.86 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  27.68 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  27.54 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  26.92 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  26.41 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  26.41 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  25.26 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  26.41 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  24.48 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  24.03 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  26.41 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  27.59 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  29.35 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  25.26 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  25.58 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  28.52 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4356  2-methylisocitrate lyase  26.16 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  27.83 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  24.03 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  24.03 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  25.68 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  25.43 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  29.55 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  25.58 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  26.69 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2153  isocitrate lyase and phosphorylmutase  29.14 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0855957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  26.77 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1831  2-methylisocitrate lyase  24.83 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  25.78 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  26.89 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>