More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0467 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  34.45 
 
 		 2845 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.73 
 
 		 4318 aa  819    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  31.53 
 
 		 2628 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.09 
 
 		 4968 aa  831    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  32.62 
 
 		 4317 aa  815    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.2 
 
 		 4336 aa  826    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  31.31 
 
 		 2625 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  32.78 
 
 		 2875 aa  827    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  30.15 
 
 		 6176 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  30.82 
 
 		 3235 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  29.12 
 
 		 3227 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  34.83 
 
 		 3404 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.79 
 
 		 7310 aa  710    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  30.83 
 
 		 3086 aa  882    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  27.12 
 
 		 2543 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  26.83 
 
 		 3044 aa  715    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  33.48 
 
 		 5213 aa  869    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.05 
 
 		 6404 aa  838    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.86 
 
 		 4317 aa  831    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  33.68 
 
 		 3432 aa  832    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.11 
 
 		 4336 aa  805    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  28.39 
 
 		 3395 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  33.38 
 
 		 4342 aa  816    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.85 
 
 		 2883 aa  830    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  32.27 
 
 		 1578 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  31.44 
 
 		 4960 aa  856    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  31.23 
 
 		 2883 aa  731    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0467  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 2105 aa  4332    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  31.98 
 
 		 3018 aa  710    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  29.16 
 
 		 6202 aa  791    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  27.41 
 
 		 4080 aa  673    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  29.83 
 
 		 3219 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  31.9 
 
 		 3498 aa  865    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  31.62 
 
 		 2033 aa  891    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  31.7 
 
 		 4960 aa  847    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  31.43 
 
 		 1990 aa  717    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  30.34 
 
 		 3287 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  32.45 
 
 		 2571 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  30.52 
 
 		 3374 aa  828    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  33.75 
 
 		 4747 aa  882    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  33.16 
 
 		 5654 aa  821    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.84 
 
 		 4502 aa  853    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  31.88 
 
 		 5467 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  32.98 
 
 		 1556 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  31.8 
 
 		 9175 aa  797    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.8 
 
 		 4991 aa  815    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  32.49 
 
 		 4332 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  29.24 
 
 		 3219 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  29.53 
 
 		 3224 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  32.26 
 
 		 4037 aa  809    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  31.06 
 
 		 3247 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  29.08 
 
 		 6113 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  29.52 
 
 		 3296 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  30.83 
 
 		 3086 aa  882    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  33.92 
 
 		 5230 aa  796    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  32.57 
 
 		 7712 aa  787    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  29.89 
 
 		 3180 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  29.55 
 
 		 3227 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.18 
 
 		 3176 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  29.6 
 
 		 3018 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.56 
 
 		 3231 aa  786    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  33.04 
 
 		 4342 aa  817    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  34.66 
 
 		 5149 aa  888    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.3 
 
 		 4317 aa  814    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  32.67 
 
 		 3942 aa  807    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  33.91 
 
 		 5328 aa  850    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  33.12 
 
 		 2651 aa  795    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  32.45 
 
 		 2571 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  30.91 
 
 		 11233 aa  720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.09 
 
 		 3297 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  33.43 
 
 		 2626 aa  816    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.09 
 
 		 3294 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.74 
 
 		 4317 aa  813    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  30.14 
 
 		 3290 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  33.13 
 
 		 2878 aa  843    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  32.44 
 
 		 2606 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  30.19 
 
 		 3290 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  31.3 
 
 		 2164 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  28.61 
 
 		 2006 aa  759    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  29.66 
 
 		 3230 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  32.85 
 
 		 1556 aa  739    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.09 
 
 		 3294 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  34.79 
 
 		 4136 aa  900    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 		 1553 aa  632  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  29.12 
 
 		 3231 aa  632  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  29.12 
 
 		 3231 aa  632  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  29.27 
 
 		 3221 aa  629  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  28.93 
 
 		 1992 aa  630  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 		 1528 aa  626  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  31.27 
 
 		 2573 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  29.5 
 
 		 3962 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  30.26 
 
 		 3208 aa  615  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  31.92 
 
 		 3710 aa  594  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  30.12 
 
 		 2752 aa  589  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.52 
 
 		 5750 aa  585  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  32.1 
 
 		 2614 aa  579  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  29.62 
 
 		 4606 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  29.15 
 
 		 2596 aa  577  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.44 
 
 		 6889 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.04 
 
 		 3308 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>