81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0448 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86.24 
 
 		 410 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.75 
 
 		 410 aa  758    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86.55 
 
 		 423 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.63 
 
 		 410 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.63 
 
 		 410 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.67 
 
 		 419 aa  746    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86.31 
 
 		 423 aa  757    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86.31 
 
 		 423 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.63 
 
 		 410 aa  749    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.26 
 
 		 410 aa  749    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.63 
 
 		 410 aa  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  84.88 
 
 		 410 aa  751    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86.24 
 
 		 410 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86.24 
 
 		 410 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86.24 
 
 		 410 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86 
 
 		 410 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.63 
 
 		 410 aa  749    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  87.29 
 
 		 419 aa  772    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  84.63 
 
 		 410 aa  749    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  88.54 
 
 		 418 aa  777    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  100 
 
 		 417 aa  875    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  98.32 
 
 		 417 aa  862    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.63 
 
 		 410 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  51.46 
 
 		 425 aa  461  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  39.23 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.32 
 
 		 348 aa  212  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.75 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  30.31 
 
 		 340 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 323 aa  143  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  29.83 
 
 		 336 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  27.59 
 
 		 350 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2249  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  33.15 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  27.37 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  26.61 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0896  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0772254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  30.58 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  28.12 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  28.57 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  24.79 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  26.11 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  25.69 
 
 		 368 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.39 
 
 		 346 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  31.67 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  26.74 
 
 		 704 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  30.77 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.17 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  31.07 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  30.23 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  25 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  32.64 
 
 		 202 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  28.24 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  24.72 
 
 		 183 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  25.99 
 
 		 176 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  25.41 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  25.7 
 
 		 175 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2830  hypothetical protein  24.59 
 
 		 189 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0770617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  23.6 
 
 		 181 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2761  hypothetical protein  27.34 
 
 		 183 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2599  hypothetical protein  23.03 
 
 		 174 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177122  normal  0.320415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  23.16 
 
 		 178 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  22.96 
 
 		 187 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1184  phosphopantetheine adenylyltransferase  27.16 
 
 		 160 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0454374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  25 
 
 		 194 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1206  phosphopantetheine adenylyltransferase  27.16 
 
 		 160 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0582  hypothetical protein  28.32 
 
 		 201 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00169014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 194 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 181 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0715  phosphopantetheine adenylyltransferase  28.75 
 
 		 161 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.429176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>