48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0405 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  94.3 
 
 		 263 aa  510  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  71.31 
 
 		 254 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  70.92 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  63.2 
 
 		 270 aa  317  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  62.11 
 
 		 281 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  61.81 
 
 		 270 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  62.4 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  61.6 
 
 		 270 aa  308  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  62 
 
 		 271 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  62 
 
 		 271 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  59.3 
 
 		 262 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  57.31 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  51.74 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  58.51 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  46.75 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  51.34 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  46.12 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  46.4 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  46.4 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  46.64 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  46.4 
 
 		 260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  45.95 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  45.95 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  45.95 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  45.05 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  45.05 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  43.82 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  43.95 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  38.65 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  46.72 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  45.45 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  36.72 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  42.41 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  44.44 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  30.71 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  29.6 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  29.09 
 
 		 321 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  27.81 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  27.9 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  26.56 
 
 		 358 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  29.93 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  29.56 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  35.63 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  28.05 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  33.75 
 
 		 356 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  27.62 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  29.55 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>