More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0351 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  93.49 
 
 		 311 aa  593  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  71.48 
 
 		 307 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  68.98 
 
 		 311 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  69.41 
 
 		 309 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  63.19 
 
 		 306 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  62.13 
 
 		 298 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  60.2 
 
 		 304 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  60.2 
 
 		 304 aa  351  7e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  55.48 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  53.95 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  52.49 
 
 		 308 aa  325  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  41.42 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  41.1 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  41.12 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  41.1 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  41.1 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  34.69 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  34.1 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  31.33 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  38.36 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  32.68 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  32.68 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  32.68 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  30.99 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  33.33 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  32.69 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  33.01 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  37.97 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  34.02 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  30.25 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  30.39 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  32.51 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  34.7 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  37.5 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  33.65 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.87 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  33.87 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  35.44 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  32.91 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  36.8 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  32.8 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  28.29 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  35.78 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  32.79 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  35.58 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  34.85 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  31.94 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  30.23 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  30.25 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  34.82 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  33.65 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  30.43 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  28.24 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  29.23 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  31.09 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  30.06 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  33.09 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  33.71 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  33.83 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  29.38 
 
 		 628 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  31.68 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  29.28 
 
 		 628 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  30.91 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  34.01 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  29.5 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl514  fructokinase  27.74 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  33.01 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  30.94 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  28.4 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  32.94 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  28.1 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>