97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0328 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 		 516 aa  1064    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  93.6 
 
 		 516 aa  1002    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  58.4 
 
 		 517 aa  599  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  38.83 
 
 		 655 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  28.12 
 
 		 741 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.54 
 
 		 696 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.57 
 
 		 661 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  27.61 
 
 		 496 aa  195  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  28.23 
 
 		 652 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  25.67 
 
 		 705 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  26.56 
 
 		 692 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  25.43 
 
 		 648 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  25.2 
 
 		 651 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  25.2 
 
 		 651 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  24.61 
 
 		 674 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  25.39 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.75 
 
 		 714 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.47 
 
 		 625 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  24.21 
 
 		 685 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  23.57 
 
 		 646 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  23.57 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  23.57 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  23.81 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  23.57 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  21.98 
 
 		 701 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  23.98 
 
 		 646 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  23.08 
 
 		 646 aa  123  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  30.98 
 
 		 646 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  23.93 
 
 		 681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  23.26 
 
 		 643 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  24.9 
 
 		 710 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  24.9 
 
 		 710 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  23.09 
 
 		 646 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  23.53 
 
 		 656 aa  118  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  22.52 
 
 		 612 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.33 
 
 		 636 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  22.42 
 
 		 637 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  22.42 
 
 		 637 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  21.84 
 
 		 701 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  22.42 
 
 		 637 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  22.22 
 
 		 637 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.58 
 
 		 709 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  22.22 
 
 		 637 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.83 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  24.36 
 
 		 636 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  23.37 
 
 		 663 aa  104  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.95 
 
 		 627 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.11 
 
 		 646 aa  103  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  22.06 
 
 		 638 aa  100  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  20.75 
 
 		 687 aa  96.3  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.28 
 
 		 628 aa  90.1  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  23.58 
 
 		 678 aa  89.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.05 
 
 		 696 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.51 
 
 		 703 aa  88.2  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  20.47 
 
 		 688 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.18 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  31.82 
 
 		 698 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  24.52 
 
 		 689 aa  84  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  22.83 
 
 		 623 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  21.94 
 
 		 559 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  21.71 
 
 		 698 aa  74.3  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  21.71 
 
 		 698 aa  74.3  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.28 
 
 		 705 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  21.76 
 
 		 668 aa  73.6  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.51 
 
 		 712 aa  73.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  23.53 
 
 		 685 aa  73.2  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  30.61 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  23.91 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  23.91 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  23.48 
 
 		 557 aa  70.5  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1524  transcriptional antiterminator, BglG  21.75 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000100792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  28.74 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  22.17 
 
 		 282 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.19 
 
 		 670 aa  61.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  22.39 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  22.17 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  26.74 
 
 		 684 aa  60.1  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  19.43 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  26.76 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  24.23 
 
 		 282 aa  53.9  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  21.55 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  23.79 
 
 		 282 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  23.79 
 
 		 282 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  23.79 
 
 		 282 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  23.79 
 
 		 282 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  24.77 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  22.91 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  23.35 
 
 		 282 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  23.35 
 
 		 282 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  22.91 
 
 		 282 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  22.91 
 
 		 282 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  22.91 
 
 		 282 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  33.78 
 
 		 275 aa  47  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  23.01 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  23.53 
 
 		 470 aa  45.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3966  transcriptional antiterminator, BglG  28.16 
 
 		 601 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0028  transcriptional antiterminator  22.1 
 
 		 644 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>