103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0197 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
182 aa  373  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  66.67 
 
 
194 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 
183 aa  234  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  66.09 
 
 
181 aa  227  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  53.53 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  51.2 
 
 
177 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  51.2 
 
 
177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  45.29 
 
 
170 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  47.17 
 
 
177 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  45.81 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  46.54 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  45.16 
 
 
167 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  45.81 
 
 
167 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  45.16 
 
 
167 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  45.16 
 
 
167 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  44.12 
 
 
170 aa  137  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  43.87 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  44.52 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  45.16 
 
 
167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  44.16 
 
 
167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  43.79 
 
 
167 aa  131  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  41.03 
 
 
176 aa  131  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  43.87 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
198 aa  127  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  37.79 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  42.48 
 
 
196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
182 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
168 aa  124  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  39.39 
 
 
174 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
175 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 
183 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
172 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  41.92 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
172 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  42.48 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  43.23 
 
 
179 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  43.79 
 
 
153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
176 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  39.41 
 
 
175 aa  114  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  41.03 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  38.41 
 
 
179 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  39.74 
 
 
426 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  45.51 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
176 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
176 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  43.23 
 
 
173 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  37.11 
 
 
175 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 
182 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6174  hypothetical protein  27.34 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2000  hypothetical protein  27.66 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1058  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2185  acetyltransferase  44.12 
 
 
83 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  43.08 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.229217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8033  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6479  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2473  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2489  acetyltransferase  32.73 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3386  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0869  acetyltransferase  32.18 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00876898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0856  acetyltransferase  32.18 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.739267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1378  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
137 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  28.12 
 
 
164 aa  44.7  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
191 aa  44.3  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3203  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1122  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.833574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2702  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.651108  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2151  acetyltransferase  36.99 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2992  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.33 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.99 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05434  acetyltransferase  32.46 
 
 
141 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1344  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
167 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000016688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2521  histidine kinase  35.37 
 
 
159 aa  41.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2274  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54285  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0760  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.08 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1001  hypothetical protein  33 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>