More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0116 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  97.25 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  81.07 
 
 		 210 aa  353  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  73.89 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  73.89 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  73.89 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  73.89 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  73.89 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  73.89 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  73.89 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  72.91 
 
 		 212 aa  307  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  72.91 
 
 		 212 aa  307  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  72.91 
 
 		 212 aa  307  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  72.91 
 
 		 212 aa  307  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  72.41 
 
 		 212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  65.2 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  64.08 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  64.22 
 
 		 210 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  60.1 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  51.22 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  51.22 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  48.53 
 
 		 222 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  47.55 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  46.83 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  47.06 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  46.6 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  47.55 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  47.06 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  50.24 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  47.67 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  50.24 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  46.88 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  47.03 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  48.28 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  46.57 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  46.86 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  45.73 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  46.08 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  46.19 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  42.36 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  48 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  46.35 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  44.27 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  47.24 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  46.73 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  44.39 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  44.62 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  43.9 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  43.55 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  45.26 
 
 		 220 aa  167  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  45.36 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  43.52 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  45.55 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  47.5 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  46.77 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  43.39 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  40.87 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  46.24 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  46.24 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  46.24 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  46.24 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  46.24 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  46.24 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  42.49 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  42.42 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  43.52 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  42.23 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  42.23 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  42.23 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  40.4 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  40.7 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  38.79 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  35.5 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  33.81 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  35.68 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  34.24 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  35.14 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  35.48 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  37.29 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.67 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  31.18 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  34.22 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.04 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  31.69 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  31.05 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  34.97 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  34.91 
 
 		 332 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  33.16 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  31.75 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 		 428 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 		 180 aa  92.4  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.61 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  30.48 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  30.98 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  31.15 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  24.76 
 
 		 303 aa  89  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  29.95 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>