More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0109 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 396 aa  812    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  77.27 
 
 		 395 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  96.21 
 
 		 396 aa  793    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  77.53 
 
 		 394 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  76.26 
 
 		 394 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  43.26 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  44.02 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  44.02 
 
 		 397 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 398 aa  338  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  41.03 
 
 		 400 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 400 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  42.39 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 402 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  41.93 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  41.67 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  42.53 
 
 		 402 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  43.46 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 395 aa  296  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 399 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  42.41 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  42.67 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  40.85 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  39.16 
 
 		 377 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  40.41 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  40.31 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.97 
 
 		 463 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.73 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  40.15 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  39.13 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  39.13 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  39.13 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  39.39 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.73 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.28 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.08 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  38.4 
 
 		 408 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  38.4 
 
 		 408 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.39 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.39 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  38.4 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.39 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.73 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.39 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.39 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.39 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 421 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  36.18 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 438 aa  256  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.44 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  35.64 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 440 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  36.69 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  36.69 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.69 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  38.07 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 611 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 401 aa  250  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  35.52 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 426 aa  249  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.1 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.59 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  34.36 
 
 		 440 aa  245  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>