31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0095 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0090  hypothetical protein  98.1 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4068  hypothetical protein  85.05 
 
 		 108 aa  186  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3983  hypothetical protein  82.08 
 
 		 106 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0573  hypothetical protein  82.08 
 
 		 106 aa  184  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0235  hypothetical protein  82.08 
 
 		 106 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3880  hypothetical protein  83.18 
 
 		 108 aa  183  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0041  hypothetical protein  57.94 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00044  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1072  hypothetical protein  48.48 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09110  hypothetical protein  49 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2030  hypothetical protein  48.08 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4840  hypothetical protein  48.98 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4662  hypothetical protein  47.96 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236064  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4786  hypothetical protein  47.96 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0776376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3777  hypothetical protein  46.73 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0697  Domain of unknown function DUF1820  47.06 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.11201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1129  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12360  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0634  hypothetical protein  45.92 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00145233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4344  hypothetical protein  43.88 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3299  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.222898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4803  hypothetical protein  43.88 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4949  hypothetical protein  43.43 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1506  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  95.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1477  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  95.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0852  hypothetical protein  44.55 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000734033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1180  hypothetical cytosolic protein  44.55 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000108466  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03549  hypothetical protein  43.3 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0366  hypothetical protein  41.75 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0330  hypothetical protein  41.75 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>