More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0093 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  60.27 
 
 
732 aa  829  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.38 
 
 
732 aa  830  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  66.67 
 
 
771 aa  973  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  63.24 
 
 
732 aa  828  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.84 
 
 
782 aa  936  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.97 
 
 
782 aa  936  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.24 
 
 
732 aa  826  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.38 
 
 
732 aa  828  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.24 
 
 
732 aa  826  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  60.4 
 
 
732 aa  832  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  60.27 
 
 
732 aa  828  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  60 
 
 
732 aa  825  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  60 
 
 
732 aa  827  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  55.68 
 
 
773 aa  721  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.38 
 
 
732 aa  830  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  100 
 
 
787 aa  1587  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.38 
 
 
732 aa  829  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  60.41 
 
 
689 aa  777  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  58.19 
 
 
768 aa  813  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  61.29 
 
 
803 aa  894  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.61 
 
 
728 aa  843  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  56.83 
 
 
768 aa  772  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  63.1 
 
 
732 aa  827  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.49 
 
 
788 aa  931  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  94.8 
 
 
784 aa  1428  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  63.24 
 
 
732 aa  828  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  48.74 
 
 
904 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  48.2 
 
 
740 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  47.03 
 
 
738 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
758 aa  618  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  48.06 
 
 
740 aa  618  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  47.97 
 
 
718 aa  606  1e-172  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  48.04 
 
 
793 aa  604  1e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 
712 aa  601  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  47.64 
 
 
732 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  46.43 
 
 
734 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  47.13 
 
 
731 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  47.35 
 
 
711 aa  572  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  48.06 
 
 
722 aa  571  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
844 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  46.58 
 
 
709 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 
712 aa  558  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  46.84 
 
 
803 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
744 aa  558  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  45.22 
 
 
720 aa  552  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  52.06 
 
 
757 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  45.83 
 
 
814 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  50.77 
 
 
726 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  45.56 
 
 
704 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  44.37 
 
 
734 aa  548  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  46.87 
 
 
731 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  51.89 
 
 
756 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  51.55 
 
 
758 aa  540  1e-152  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  50.34 
 
 
764 aa  540  1e-152  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  49.74 
 
 
678 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  44.52 
 
 
716 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  44.79 
 
 
713 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  50.08 
 
 
955 aa  528  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  48.99 
 
 
634 aa  517  1e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  52.32 
 
 
759 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  52.41 
 
 
759 aa  508  1e-142  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  38.97 
 
 
712 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.04 
 
 
712 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
712 aa  486  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  40.99 
 
 
707 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.48 
 
 
783 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  40.56 
 
 
735 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
734 aa  462  1e-128  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.39 
 
 
709 aa  454  1e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.27 
 
 
767 aa  454  1e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  43.87 
 
 
673 aa  454  1e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  38.75 
 
 
713 aa  452  1e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
750 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 
750 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  36.4 
 
 
769 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  47.41 
 
 
777 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  39.55 
 
 
750 aa  442  1e-122  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
791 aa  440  1e-122  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  38.65 
 
 
750 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  37.5 
 
 
711 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  37.24 
 
 
752 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
939 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  43.98 
 
 
701 aa  432  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
748 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  35.18 
 
 
833 aa  432  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  37.78 
 
 
713 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
800 aa  429  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  42.58 
 
 
709 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
796 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.47 
 
 
726 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 
800 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
801 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  39 
 
 
742 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  37.71 
 
 
799 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 
800 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  37.89 
 
 
984 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  38.58 
 
 
738 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  37.89 
 
 
984 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
825 aa  417  1e-115  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
866 aa  419  1e-115  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>