41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0081 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4026  hypothetical protein  61.75 
 
 		 559 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0078  cellulose synthase operon protein YhjU  94.39 
 
 		 552 aa  1068    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0081  cellulose synthase operon protein YhjU  100 
 
 		 553 aa  1139    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03339  hypothetical protein  61.57 
 
 		 559 aa  720    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4904  hypothetical protein  61.75 
 
 		 559 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4001  endoglucanase BcsG  63.85 
 
 		 559 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3833  cellulose synthase operon protein YhjU  63.67 
 
 		 559 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3819  cellulose synthase operon protein YhjU  63.67 
 
 		 559 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552389  normal  0.251037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3941  cellulose synthase operon protein YhjU  63.67 
 
 		 559 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3897  cellulose synthase operon protein YhjU  63.67 
 
 		 559 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3847  hypothetical protein  61.57 
 
 		 559 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0178  hypothetical protein  61.38 
 
 		 559 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0143  hypothetical protein  74.77 
 
 		 550 aa  865    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03386  predicted inner membrane protein  61.57 
 
 		 559 aa  720    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3935  hypothetical protein  62.41 
 
 		 559 aa  728    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0965348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0175  cellulose synthase operon protein YhjU  61.57 
 
 		 559 aa  720    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3996  hypothetical protein  59.23 
 
 		 442 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2133  hypothetical protein  46.27 
 
 		 537 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3200  hypothetical protein  46.3 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.33903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2632  hypothetical protein  46.27 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.346191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0937  membrane protein  41.37 
 
 		 541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.303935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1168  hypothetical protein  36.86 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.710032  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3520  hypothetical protein  36.94 
 
 		 522 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0949443  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0798  hypothetical protein  37.38 
 
 		 521 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.123535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1364  cellulose synthase operon protein YhjU  35.8 
 
 		 518 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0972818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1920  hypothetical protein  35.47 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2257  hypothetical protein  39.7 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.293956 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1386  hypothetical protein  35.61 
 
 		 518 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0904  hypothetical protein  35.61 
 
 		 518 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4531  hypothetical protein  35.03 
 
 		 518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1298  hypothetical protein  36.48 
 
 		 516 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.422934  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2073  cellulose synthase operon protein YhjU  35.2 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289542 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0692  hypothetical protein  35.59 
 
 		 518 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.231453  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1584  hypothetical protein  35.59 
 
 		 518 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0611442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2014  hypothetical protein  35.59 
 
 		 518 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1264  hypothetical protein  36.86 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2225  hypothetical protein  35.4 
 
 		 518 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0625  hypothetical protein  35.97 
 
 		 518 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2139  hypothetical protein  36.16 
 
 		 518 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3733  hypothetical protein  68.21 
 
 		 188 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3998  hypothetical protein  72.22 
 
 		 120 aa  169  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>