17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0078 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0078  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0075  hypothetical protein  94.2 
 
 		 69 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0146  hypothetical protein  52.17 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3997  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3829  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3816  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0314288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3937  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.22797  normal  0.698427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3893  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.894796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3932  putative cytoplasmic protein  42.62 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.650112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03383  hypothetical protein  39.68 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0182  hypothetical protein  39.68 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4023  hypothetical protein  39.68 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03336  hypothetical protein  39.68 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0178  conserved hypothetical protein  39.68 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3844  hypothetical protein  39.68 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.558225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4901  hypothetical protein  39.68 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3941  hypothetical protein  38.1 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>