86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0073 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  50.87 
 
 		 1140 aa  1126    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  50.94 
 
 		 1157 aa  1135    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  51.17 
 
 		 1180 aa  1122    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  51.26 
 
 		 1150 aa  1125    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  51.12 
 
 		 1172 aa  1124    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  51.34 
 
 		 1150 aa  1127    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  50.68 
 
 		 1157 aa  1129    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  50.88 
 
 		 1160 aa  1134    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  51.08 
 
 		 1180 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  41.17 
 
 		 1172 aa  803    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  100 
 
 		 1164 aa  2353    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  68.38 
 
 		 1157 aa  1624    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  40.78 
 
 		 1186 aa  803    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  50.68 
 
 		 1157 aa  1129    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  50.6 
 
 		 1157 aa  1125    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  41.15 
 
 		 1172 aa  802    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  92.01 
 
 		 1159 aa  2148    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  50.68 
 
 		 1157 aa  1129    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  50.6 
 
 		 1157 aa  1125    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  65.53 
 
 		 289 aa  382  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  28.69 
 
 		 1267 aa  227  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  27.81 
 
 		 1265 aa  221  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  31.46 
 
 		 1315 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  31.53 
 
 		 1313 aa  208  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  30 
 
 		 1315 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  30.98 
 
 		 1259 aa  205  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  34.22 
 
 		 1271 aa  204  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  31.52 
 
 		 1297 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  31.35 
 
 		 1297 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  31.35 
 
 		 1297 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  32.88 
 
 		 1230 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  33.33 
 
 		 1548 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1580 aa  187  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1544 aa  187  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1574 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1574 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  33.42 
 
 		 1471 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1266 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  28.43 
 
 		 1588 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  27.67 
 
 		 1542 aa  171  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  27.37 
 
 		 1569 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  30.87 
 
 		 1244 aa  169  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  34.05 
 
 		 1324 aa  159  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  32.21 
 
 		 1367 aa  154  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  32.75 
 
 		 1331 aa  146  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  29.08 
 
 		 1309 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  27.07 
 
 		 815 aa  68.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.17 
 
 		 725 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  28.47 
 
 		 417 aa  57  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.8 
 
 		 643 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 878 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.21 
 
 		 810 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 594 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1297 aa  50.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 1404 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 265 aa  49.3  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  25.62 
 
 		 283 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  23.05 
 
 		 1098 aa  49.3  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 2240 aa  48.5  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.88 
 
 		 786 aa  48.5  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 265 aa  48.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 643 aa  48.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 4079 aa  47.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  21.45 
 
 		 699 aa  47.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 		 1737 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.44 
 
 		 142 aa  47.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42758  predicted protein  23.45 
 
 		 1346 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.59748  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 833 aa  46.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 1252 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 292 aa  46.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 		 321 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 2262 aa  46.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 515 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 292 aa  45.8  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 3145 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 632 aa  45.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 291 aa  45.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 927 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.02 
 
 		 622 aa  45.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 301 aa  45.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  21.38 
 
 		 302 aa  45.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  36.99 
 
 		 379 aa  45.4  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  24.27 
 
 		 864 aa  45.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 722 aa  45.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 390 aa  44.7  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 673 aa  44.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>