More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0072 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  587  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.47 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.48 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  30.98 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.85 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  30.1 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  29.19 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  29.1 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  30.33 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  29.15 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  26.03 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  27.91 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.97 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.43 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.78 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.92 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  28.09 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  30.07 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  29.51 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  26.5 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  28.04 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.01 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  27.72 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  29.01 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  29 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  28.09 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  29.49 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  27.16 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  30.1 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  25.77 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  27.99 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  27.36 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  25.7 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.3 
 
 		 306 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  27.05 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  26.96 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.28 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.53 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.07 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  27.36 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  29.31 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  21.38 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  26.06 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.73 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.28 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  24.73 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  26.64 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.4 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.97 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  27.67 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.75 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.96 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  26.03 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  26.71 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.75 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.75 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.26 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  26.69 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2730  hypothetical protein  24.5 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.64 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  27.39 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  24.41 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  24.01 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  23.37 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  25.42 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  23.37 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  24.18 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  26.69 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.76 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  25.6 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.43 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.85 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  24.73 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 314 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  24.73 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  24.73 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  24.73 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>