26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0071 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0071  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  710    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  30.23 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3700  hypothetical protein  26.47 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0911  hypothetical protein  23.16 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  23.98 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  23.49 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4825  hypothetical protein  23.4 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  21.43 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  22 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  21.84 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  23.38 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  27.03 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  23.22 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  21.99 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  24.84 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  23.53 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  22.06 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  21.15 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  24.49 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  21.15 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  22.96 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1287  hypothetical protein  26.03 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143964  normal  0.0342007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0775  hypothetical protein  23.02 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  21.86 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  22.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>