29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0056 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  96.52 
 
 		 402 aa  806    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  828    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  88.06 
 
 		 402 aa  744    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  87.81 
 
 		 402 aa  745    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  68.66 
 
 		 402 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  48.99 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  49.61 
 
 		 404 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  48.13 
 
 		 405 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  48.63 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  49.6 
 
 		 381 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  44.88 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  44.27 
 
 		 391 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  42.57 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  34.96 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  28 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  24.65 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  26.86 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  23.88 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  23.94 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  25.07 
 
 		 353 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  24.15 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  24.21 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  24.92 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  24.1 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  23.6 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  21.2 
 
 		 279 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  23.78 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  27.18 
 
 		 109 aa  47  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  22.18 
 
 		 279 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>