More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0021 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.67 
 
 		 612 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 623 aa  668    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.12 
 
 		 633 aa  644    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.57 
 
 		 610 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  58.15 
 
 		 627 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  55.67 
 
 		 623 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 623 aa  668    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.54 
 
 		 633 aa  658    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  56.67 
 
 		 612 aa  668    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.62 
 
 		 617 aa  787    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  57.43 
 
 		 629 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.34 
 
 		 620 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 629 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 623 aa  666    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.81 
 
 		 629 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  98 
 
 		 601 aa  1199    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  55.59 
 
 		 633 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  55.5 
 
 		 623 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 		 629 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.41 
 
 		 626 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.82 
 
 		 623 aa  685    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.33 
 
 		 662 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 623 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  68.39 
 
 		 597 aa  834    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  57.5 
 
 		 643 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.25 
 
 		 632 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  57.17 
 
 		 632 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  56.26 
 
 		 640 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  65.55 
 
 		 611 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  64.82 
 
 		 612 aa  784    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  57 
 
 		 623 aa  682    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  64.32 
 
 		 613 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  57.02 
 
 		 630 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  68.11 
 
 		 595 aa  807    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.19 
 
 		 625 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  56.03 
 
 		 640 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  64.26 
 
 		 619 aa  780    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.59 
 
 		 637 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 623 aa  670    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  55.5 
 
 		 623 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  62.88 
 
 		 615 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  58.18 
 
 		 593 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  61.14 
 
 		 609 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  64.38 
 
 		 613 aa  760    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.92 
 
 		 633 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  55.33 
 
 		 623 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  100 
 
 		 610 aa  1244    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  58.31 
 
 		 625 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  66.44 
 
 		 611 aa  793    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  53.33 
 
 		 611 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.37 
 
 		 611 aa  769    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  64.55 
 
 		 611 aa  789    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.69 
 
 		 631 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  55.33 
 
 		 623 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 623 aa  666    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.59 
 
 		 625 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  53.15 
 
 		 664 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  53.78 
 
 		 619 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.18 
 
 		 649 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  53.61 
 
 		 619 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  52.13 
 
 		 673 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  52.13 
 
 		 673 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  52.74 
 
 		 640 aa  628  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  52.33 
 
 		 624 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  55.67 
 
 		 634 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 623 aa  626  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.67 
 
 		 634 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1769  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 676 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  51.32 
 
 		 623 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.43 
 
 		 633 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.17 
 
 		 634 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 		 662 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  50.91 
 
 		 606 aa  616  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  52.57 
 
 		 609 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  51.67 
 
 		 599 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  51.65 
 
 		 588 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  51.59 
 
 		 562 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  51.51 
 
 		 592 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.92 
 
 		 596 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  50.84 
 
 		 592 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  50.67 
 
 		 592 aa  555  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  49.75 
 
 		 586 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 609 aa  538  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  46.14 
 
 		 620 aa  526  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  48 
 
 		 582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3807  ABC transporter related  47.74 
 
 		 568 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  hitchhiker  0.00204057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  45.28 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 		 695 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 568 aa  508  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  46.46 
 
 		 586 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.01 
 
 		 674 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  48.51 
 
 		 583 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 619 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  47.57 
 
 		 545 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  47.99 
 
 		 573 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 		 659 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.43 
 
 		 571 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  46.6 
 
 		 563 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.97 
 
 		 690 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 615 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>