157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  96.88 
 
 
288 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  85.07 
 
 
288 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  85.76 
 
 
288 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  80.42 
 
 
290 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  80.35 
 
 
290 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  80.35 
 
 
290 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  80.7 
 
 
290 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  78.12 
 
 
290 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  58.1 
 
 
286 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  58.1 
 
 
286 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  58.1 
 
 
286 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  58.1 
 
 
286 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  59.51 
 
 
286 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  59.51 
 
 
286 aa  341  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  57.75 
 
 
286 aa  341  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  57.75 
 
 
286 aa  341  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  57.75 
 
 
286 aa  341  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  57.75 
 
 
286 aa  341  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0266148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  57.75 
 
 
287 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  57.75 
 
 
287 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  57.75 
 
 
286 aa  340  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  57.75 
 
 
286 aa  340  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  57.75 
 
 
286 aa  338  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  58.1 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  59.01 
 
 
286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  58.3 
 
 
286 aa  332  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  56.34 
 
 
286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  56.34 
 
 
286 aa  322  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  55.67 
 
 
288 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  54.96 
 
 
312 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  50.53 
 
 
286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  54.23 
 
 
287 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  53.21 
 
 
287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  52.63 
 
 
289 aa  299  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  52.3 
 
 
287 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  52.86 
 
 
286 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  53.21 
 
 
354 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  51.79 
 
 
286 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  51.79 
 
 
286 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  53.21 
 
 
296 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  52.5 
 
 
287 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  52.5 
 
 
287 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  52.5 
 
 
309 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  53.21 
 
 
286 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  53.21 
 
 
286 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  52.14 
 
 
287 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  52.14 
 
 
309 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  52.86 
 
 
286 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  52.14 
 
 
309 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  48.39 
 
 
289 aa  265  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  46.76 
 
 
289 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  43.31 
 
 
293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  44.17 
 
 
293 aa  228  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  42.16 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  44.6 
 
 
282 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  40.78 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  40.28 
 
 
282 aa  219  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  40.07 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  42.24 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  40.78 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  42.24 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  42.6 
 
 
283 aa  212  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  42.81 
 
 
282 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  42.96 
 
 
283 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  42.86 
 
 
282 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  42.81 
 
 
290 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  43.88 
 
 
282 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  40.7 
 
 
313 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  38.59 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  36.1 
 
 
288 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  37.46 
 
 
291 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  35.14 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  35.82 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  37.09 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  34.69 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  35.94 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  34.67 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  35.34 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  33.92 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  33.22 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  32.62 
 
 
293 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  33.33 
 
 
278 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  32.62 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  36.73 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  32.73 
 
 
300 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  32.52 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2881  pyridoxal kinase  29.49 
 
 
291 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  32.17 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  32.64 
 
 
298 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04250  bud site selection-related protein, putative  41.5 
 
 
402 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  34.56 
 
 
298 aa  109  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  33.97 
 
 
271 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  32.62 
 
 
292 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  27.76 
 
 
283 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  27.76 
 
 
283 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  27.38 
 
 
283 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  27.76 
 
 
283 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  27.38 
 
 
283 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  27.76 
 
 
283 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>