More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  97.39 
 
 
307 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  65.46 
 
 
309 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  64.82 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  64.59 
 
 
302 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  65.79 
 
 
318 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  66.23 
 
 
302 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  65.56 
 
 
302 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  63.43 
 
 
311 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  68.88 
 
 
297 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.11 
 
 
310 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.11 
 
 
352 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.92 
 
 
340 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.76 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.76 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.76 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.76 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.76 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  37.76 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  37.76 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  39.33 
 
 
295 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.25 
 
 
318 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.91 
 
 
318 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.77 
 
 
321 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.25 
 
 
339 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 
347 aa  205  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  38.23 
 
 
293 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.28 
 
 
314 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 
344 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.72 
 
 
339 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  41.28 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.45 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.34 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.34 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  37.58 
 
 
308 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  33.1 
 
 
297 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  36.16 
 
 
351 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 
328 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  36.9 
 
 
297 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  38.12 
 
 
332 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  38.54 
 
 
329 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  32.32 
 
 
303 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  29.21 
 
 
356 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 
321 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  69.9 
 
 
350 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  34.42 
 
 
336 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 
326 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  28.49 
 
 
362 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  38.55 
 
 
369 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  27.63 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  26.07 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.54 
 
 
282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  33.13 
 
 
347 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  33.03 
 
 
345 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 
333 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  31.07 
 
 
294 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  31.79 
 
 
378 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.94 
 
 
372 aa  119  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 
310 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  23.02 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  28.46 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  31.4 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  31.93 
 
 
326 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  31.15 
 
 
318 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  30.31 
 
 
293 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.01 
 
 
320 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.36 
 
 
322 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
292 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.48 
 
 
318 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  25.27 
 
 
317 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  28.94 
 
 
323 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  25.27 
 
 
317 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 
344 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27 
 
 
288 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  24.44 
 
 
296 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  29.24 
 
 
276 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.26 
 
 
316 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  24.91 
 
 
316 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.79 
 
 
349 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  24.91 
 
 
316 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 
317 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  25.37 
 
 
316 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.21 
 
 
316 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.81 
 
 
316 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  26.8 
 
 
302 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  25.37 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.15 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>