More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  567  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  75.64 
 
 
272 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  55.04 
 
 
276 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  56.57 
 
 
257 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  47.89 
 
 
287 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  47 
 
 
294 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  29.96 
 
 
237 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  29.83 
 
 
237 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
255 aa  92  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.73 
 
 
243 aa  84.7  1e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
289 aa  84.7  2e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
239 aa  82.8  5e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
243 aa  82.4  7e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
237 aa  80.1  4e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
238 aa  77  3e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
238 aa  76.3  5e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 
240 aa  76.6  5e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  26.25 
 
 
241 aa  75.1  1e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  26.38 
 
 
241 aa  75.5  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
249 aa  74.3  2e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
251 aa  72.8  7e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
1106 aa  68.2  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 
241 aa  68.2  1e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  32.87 
 
 
259 aa  68.2  1e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  26.45 
 
 
243 aa  67.4  3e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  26.45 
 
 
243 aa  67.4  3e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  24.47 
 
 
240 aa  67  3e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  26.45 
 
 
243 aa  67.4  3e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 
210 aa  65.5  8e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
248 aa  65.5  9e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  25.33 
 
 
239 aa  64.3  2e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
250 aa  63.5  3e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  27.33 
 
 
244 aa  63.5  3e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
222 aa  60.8  2e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  25.93 
 
 
274 aa  61.2  2e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
242 aa  60.5  3e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
711 aa  60.5  3e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
242 aa  60.5  3e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
259 aa  60.5  3e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
634 aa  60.1  4e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
259 aa  60.1  4e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
259 aa  60.1  4e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
284 aa  60.1  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.4 
 
 
272 aa  59.7  5e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.41 
 
 
282 aa  59.3  6e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.09916e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  30 
 
 
208 aa  59.3  7e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
710 aa  58.9  8e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
259 aa  58.9  9e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
263 aa  58.5  1e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
261 aa  58.2  1e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  27.89 
 
 
243 aa  58.5  1e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
242 aa  58.9  1e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  34.46 
 
 
253 aa  58.9  1e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  38 
 
 
281 aa  57.8  2e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
243 aa  57.4  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
236 aa  57.8  2e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
248 aa  57.8  2e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 
238 aa  57  3e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
264 aa  57.4  3e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
274 aa  57  3e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 
236 aa  57.4  3e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60342e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.71 
 
 
345 aa  56.6  4e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
233 aa  56.6  4e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  23.23 
 
 
225 aa  56.6  4e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
255 aa  56.6  4e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
219 aa  56.2  5e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
249 aa  56.2  5e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
259 aa  56.2  6e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  26.67 
 
 
258 aa  56.2  6e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  40 
 
 
262 aa  55.8  7e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  25.3 
 
 
211 aa  55.8  7e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
244 aa  55.8  8e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
283 aa  55.8  8e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
204 aa  55.5  9e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
330 aa  54.7  1e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.69 
 
 
235 aa  55.1  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
280 aa  55.5  1e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  33.56 
 
 
237 aa  55.1  1e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  25.9 
 
 
305 aa  55.5  1e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
239 aa  54.7  1e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
239 aa  55.1  1e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
319 aa  55.1  1e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  27.42 
 
 
307 aa  54.7  1e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.42 
 
 
243 aa  55.5  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3993  hypothetical protein  34.21 
 
 
292 aa  54.7  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  25 
 
 
222 aa  55.1  1e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
246 aa  55.1  1e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
246 aa  55.1  1e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  25.73 
 
 
239 aa  55.5  1e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
288 aa  53.9  2e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.7512e-06  unclonable  8.42033e-06 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
261 aa  54.7  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.32 
 
 
237 aa  54.7  2e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.32 
 
 
237 aa  54.7  2e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
283 aa  54.3  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
257 aa  54.7  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
265 aa  54.3  2e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.45 
 
 
250 aa  54.7  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
204 aa  54.7  2e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
226 aa  54.7  2e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
250 aa  53.5  3e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>