15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  100 
 
 
1174 aa  2377    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  29.12 
 
 
1225 aa  245  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  28.02 
 
 
1126 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  27.63 
 
 
1132 aa  94.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  28.9 
 
 
1142 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  27.59 
 
 
1146 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  26.32 
 
 
1085 aa  85.9  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0041  hypothetical protein  24.57 
 
 
1099 aa  73.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3851  hypothetical protein  21.19 
 
 
1104 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  24.68 
 
 
996 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003065  membrane protein putative  35.4 
 
 
1173 aa  52.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02779  hypothetical protein  31.08 
 
 
573 aa  52  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  25.08 
 
 
996 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1299  hypothetical protein  24.02 
 
 
1191 aa  48.1  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  22.64 
 
 
1461 aa  45.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>