78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68280 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_68280  dicarboxylate transporter  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.408841  normal  0.10811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5907  dicarboxylate transporter  98.1 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4296  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  77.99 
 
 		 209 aa  334  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03640  TRAP dicarboxylic acid transporter, small integral-membrane component, DctQ  75.48 
 
 		 210 aa  319  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52820  C4-dicarboxylate transporter  69.9 
 
 		 212 aa  291  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4629  C4-dicarboxylate transporter  69.9 
 
 		 217 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3051  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  65.55 
 
 		 210 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3328  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.45 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0619  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.46 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2716  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.82 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00307588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2909  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  26.79 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3135  C4-dicarboxylate transporter, putative  28.89 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2950  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.74 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.0653246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2807  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.74 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2825  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.74 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1551  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.74 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.202687  normal  0.417908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1362  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.55 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0803937  normal  0.0447503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1415  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.11 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1427  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.55 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000465338  normal  0.728772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2501  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.22 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1445  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.11 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.361291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1725  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.12 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529876  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2210  C4-dicarboxylate transporter, putative  25.11 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1812  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.39 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.133229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004049  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component  26.7 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1518  putative C4-dicarboxylate transport protein DctQ  25.57 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3680  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.25 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340738  normal  0.343344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0709  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  26.01 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6042  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component (dctQ subunit)  29.74 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0539  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  25.93 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2570  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4121  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.4 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0911  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  28.57 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5945  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.43 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1482  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.84 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149014  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4174  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.84 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00728249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5227  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.25 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0918  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.7 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3265  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.58 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3482  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.27 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3677  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.8 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3397  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.21 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3233  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.84 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.71 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455407  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2114  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.63 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2261  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.96 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2660  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.15 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0242  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.32 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.42927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4195  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.71 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1289  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.78 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1823  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.4 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000404138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0544  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.68 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.557919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2992  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.05 
 
 		 260 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0958694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0446  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.93 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000156898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1575  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.8 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2559  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  33.33 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000186717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3543  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.82 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.186116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1940  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.77 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0344722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1743  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.43 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0195  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  45.61 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224778  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07670  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  33.33 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2786  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.68 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.478705  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3156  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 		 176 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3002  TRAP transporter - DctQ subunit  25 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0449  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.48 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0330  TRAP transporter, DctQ-like membrane protein  25 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0353  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.91 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0563377  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0720  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.59 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0208  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.78 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2756  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  24.41 
 
 		 628 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.95761  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4431  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.48 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1267  aspartate kinase, monofunctional class  20.98 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457772  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1931  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.06 
 
 		 640 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3296  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  35 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4386  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.3 
 
 		 628 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575529  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1646  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.33 
 
 		 186 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.69 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2444  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.13 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>