129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62230 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  74.3 
 
 
502 aa  783    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  72.12 
 
 
512 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  71.73 
 
 
556 aa  769    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  71.76 
 
 
518 aa  758    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  73.27 
 
 
518 aa  789    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1069    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  72.12 
 
 
533 aa  752    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  76.15 
 
 
551 aa  824    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  74.42 
 
 
533 aa  809    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  95.96 
 
 
520 aa  1038    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  73.46 
 
 
520 aa  802    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  73.08 
 
 
520 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  50 
 
 
526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  47.44 
 
 
527 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  46.26 
 
 
520 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  47.23 
 
 
513 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  45.92 
 
 
509 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  43.19 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  44.51 
 
 
544 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  43.33 
 
 
509 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  41.55 
 
 
520 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  40 
 
 
530 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  41.37 
 
 
508 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  44.4 
 
 
509 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  41.87 
 
 
506 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  42.53 
 
 
535 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  37.72 
 
 
516 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  38.21 
 
 
540 aa  364  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  38.48 
 
 
532 aa  360  4e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  38.96 
 
 
504 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  39.96 
 
 
510 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  38.76 
 
 
518 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  38.66 
 
 
516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  40.51 
 
 
482 aa  330  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  40.85 
 
 
523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  41.25 
 
 
523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  40.21 
 
 
498 aa  326  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  37.45 
 
 
508 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  38.49 
 
 
513 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  38.49 
 
 
513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  38.32 
 
 
522 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  38.95 
 
 
497 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  38.38 
 
 
504 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  35.25 
 
 
525 aa  309  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  37.4 
 
 
520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  35.8 
 
 
519 aa  306  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  36.97 
 
 
579 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  35.41 
 
 
520 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  38.45 
 
 
523 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  35.96 
 
 
556 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  36.75 
 
 
518 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  35.15 
 
 
520 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  34.76 
 
 
520 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  35.15 
 
 
520 aa  290  4e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  39.74 
 
 
514 aa  290  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  34.29 
 
 
527 aa  289  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  37.73 
 
 
517 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  36.9 
 
 
516 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  36.9 
 
 
516 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  37.14 
 
 
549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  35.94 
 
 
518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  38.96 
 
 
518 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  38.11 
 
 
536 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  38.75 
 
 
514 aa  267  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  34.69 
 
 
521 aa  266  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  36.35 
 
 
528 aa  259  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2314  hypothetical protein  36.06 
 
 
613 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  35.06 
 
 
569 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  35.79 
 
 
603 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  36.18 
 
 
600 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  36.18 
 
 
600 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  36.18 
 
 
600 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  36.18 
 
 
600 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  35.06 
 
 
603 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  35.43 
 
 
544 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  37.08 
 
 
514 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  33.66 
 
 
525 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  33.48 
 
 
533 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  31.62 
 
 
529 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  34.46 
 
 
519 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  34.24 
 
 
547 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  31.69 
 
 
526 aa  212  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  34.62 
 
 
499 aa  209  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  33.33 
 
 
512 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 
524 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  33.4 
 
 
505 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  34.66 
 
 
526 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  32.72 
 
 
526 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  33.96 
 
 
505 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  33.2 
 
 
505 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  32.45 
 
 
515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  35.33 
 
 
521 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  31.89 
 
 
523 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  33.69 
 
 
518 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  31.89 
 
 
533 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  32.93 
 
 
338 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  29.44 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  31.2 
 
 
542 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  31.01 
 
 
325 aa  171  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  31.61 
 
 
520 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>