More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  99.1 
 
 
335 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  100 
 
 
335 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  65.81 
 
 
336 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  58.26 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  58.26 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  57.66 
 
 
337 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  58.56 
 
 
337 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  45.45 
 
 
343 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  44.61 
 
 
347 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  40.58 
 
 
333 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  43.05 
 
 
354 aa  259  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  40.87 
 
 
338 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  42.99 
 
 
329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  44.41 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  40.61 
 
 
339 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  44.31 
 
 
344 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  45.02 
 
 
338 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 
337 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  40.3 
 
 
339 aa  248  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  40.3 
 
 
339 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  38.76 
 
 
338 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  40.13 
 
 
342 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  40.13 
 
 
342 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  40.13 
 
 
342 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 
338 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 
341 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  39.86 
 
 
341 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  41.92 
 
 
351 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  41.92 
 
 
352 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  38.87 
 
 
338 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  38.24 
 
 
338 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  38.76 
 
 
348 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  38.11 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
372 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  36.18 
 
 
349 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  34.53 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
355 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 
342 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  37.06 
 
 
363 aa  186  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  36.22 
 
 
356 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
340 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  36.28 
 
 
345 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  32.9 
 
 
366 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  32.66 
 
 
353 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  32.93 
 
 
328 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 
365 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 
365 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
351 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  32.48 
 
 
340 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
353 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
339 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 
337 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.09 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  31.96 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  29.55 
 
 
349 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  30.55 
 
 
353 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
381 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
382 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.16 
 
 
334 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.47 
 
 
334 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1261  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  26.53 
 
 
343 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13311  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.07 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.327656  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  28.1 
 
 
385 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.15 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  28.94 
 
 
366 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 
374 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
350 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 
350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  24.09 
 
 
374 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.4 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  27.58 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13521  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  26.58 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 
423 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  30.63 
 
 
335 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  27.6 
 
 
344 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.67 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13611  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  26.18 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  28.01 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.99 
 
 
380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.12 
 
 
341 aa  110  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  25.83 
 
 
332 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  30.99 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  26.13 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
349 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  27.65 
 
 
342 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 
392 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>