More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  50.54 
 
 		 817 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  98.79 
 
 		 764 aa  1493    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  47.19 
 
 		 732 aa  653    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  50.68 
 
 		 808 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  50.27 
 
 		 808 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  48.06 
 
 		 746 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  45.49 
 
 		 745 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  45.76 
 
 		 745 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 742 aa  1504    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  49.18 
 
 		 733 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  45.36 
 
 		 745 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  48.97 
 
 		 732 aa  665    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  46.84 
 
 		 726 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  44.99 
 
 		 723 aa  631  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  46.84 
 
 		 726 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  46.06 
 
 		 723 aa  627  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  46.84 
 
 		 726 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  43.47 
 
 		 698 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 751 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 758 aa  348  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 		 755 aa  287  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  29.17 
 
 		 816 aa  257  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  29.37 
 
 		 813 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 849 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 839 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 718 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 843 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.36 
 
 		 709 aa  211  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 701 aa  209  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 738 aa  208  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  29.07 
 
 		 812 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 723 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 701 aa  205  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 723 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 725 aa  200  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 723 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 725 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 721 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 725 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 725 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 723 aa  195  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 704 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 809 aa  190  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  25.13 
 
 		 714 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 700 aa  180  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  26.92 
 
 		 713 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 716 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  26.56 
 
 		 717 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  25.45 
 
 		 704 aa  163  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 713 aa  159  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 753 aa  157  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 783 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 728 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  25.23 
 
 		 721 aa  150  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 724 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 739 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 716 aa  146  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 697 aa  146  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  31.33 
 
 		 332 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  24.97 
 
 		 771 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 817 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.59 
 
 		 867 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.62 
 
 		 862 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.59 
 
 		 862 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.34 
 
 		 646 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 698 aa  84  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.78 
 
 		 862 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 634 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 675 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.25 
 
 		 759 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.78 
 
 		 859 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  32.18 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  28.57 
 
 		 764 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  32.73 
 
 		 638 aa  77.4  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  28.57 
 
 		 764 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.34 
 
 		 616 aa  77  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  30.31 
 
 		 613 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 642 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  23.59 
 
 		 713 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.02 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.02 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.02 
 
 		 659 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.02 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.02 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.02 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  33.53 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  30.57 
 
 		 646 aa  73.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 746 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  40.29 
 
 		 677 aa  73.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  36.08 
 
 		 675 aa  73.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.15 
 
 		 661 aa  73.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 706 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  36 
 
 		 618 aa  71.6  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 628 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 764 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>