92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  98.78 
 
 		 327 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  74.92 
 
 		 328 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  74.31 
 
 		 328 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  74.01 
 
 		 328 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  72.78 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  74.01 
 
 		 328 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  70.95 
 
 		 328 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  70.95 
 
 		 328 aa  454  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  71.25 
 
 		 328 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  67.18 
 
 		 329 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  37.86 
 
 		 843 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  37.11 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  39.69 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  34.78 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  36.01 
 
 		 324 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  34.64 
 
 		 343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  36.25 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  32.93 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  33.63 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 367 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 367 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  33.73 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  29.34 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  29.52 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  29.87 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.18 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.13 
 
 		 413 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.96 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.13 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  28.3 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 361 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.97 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  27.7 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.82 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  25.29 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  24.05 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  23.99 
 
 		 484 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  37.89 
 
 		 421 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  41.43 
 
 		 415 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  30.21 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  35.88 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  42 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  42 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  35.88 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  35.88 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  23.66 
 
 		 539 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  22.61 
 
 		 439 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  22.19 
 
 		 353 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  50 
 
 		 575 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8301  D-nopaline dehydrogenase  42.86 
 
 		 464 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.909485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 		 482 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  33.93 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  31.91 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  33.33 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  42.19 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  43.64 
 
 		 493 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  43.64 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  31.87 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  29.5 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.31 
 
 		 469 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  48.98 
 
 		 436 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  31.62 
 
 		 445 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  30.68 
 
 		 438 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0610  steroid monooxygenase  28.16 
 
 		 606 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  31.65 
 
 		 512 aa  42.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>