More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59770  putative two component response regulator  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114482  hitchhiker  1.6476100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3018  LuxR family DNA-binding response regulator  90 
 
 		 221 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  39.35 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  39.35 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  40.09 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  40.09 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  40.09 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  40.09 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  38.71 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  38.25 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  39.15 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  38.68 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  37.38 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  37.38 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  35.51 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  37.5 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  35.98 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  35.98 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 218 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  37.5 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  36.07 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  37.69 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  37.69 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  37.69 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  37.69 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  34.1 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  32.86 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  32.86 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141427  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  35.98 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  34.91 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  33.81 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  33.49 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  33.49 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.57 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  33.96 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 215 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4627  two component LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.527017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  32.55 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4071  two component LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  32.39 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0030  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  31.92 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  31.92 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  31.92 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>