194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  69.57 
 
 
586 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  100 
 
 
545 aa  1093    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  49.17 
 
 
585 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  49.35 
 
 
550 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  48.46 
 
 
607 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  46.3 
 
 
583 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  46.24 
 
 
553 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.5 
 
 
554 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  34.89 
 
 
554 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.27 
 
 
554 aa  291  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  35.37 
 
 
556 aa  273  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.04 
 
 
569 aa  260  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  32.2 
 
 
548 aa  253  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.74 
 
 
561 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.07 
 
 
572 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.39 
 
 
578 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  31.35 
 
 
567 aa  204  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  31.35 
 
 
567 aa  204  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  31.35 
 
 
567 aa  204  4e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  29.97 
 
 
576 aa  189  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.52 
 
 
595 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.11 
 
 
567 aa  183  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.64 
 
 
592 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.1 
 
 
590 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.22 
 
 
571 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  29.82 
 
 
442 aa  176  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  32.11 
 
 
576 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  31.97 
 
 
575 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  27.97 
 
 
596 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.97 
 
 
596 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  28.22 
 
 
596 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.99 
 
 
747 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.88 
 
 
574 aa  153  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.12 
 
 
545 aa  150  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  27.72 
 
 
581 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  30.97 
 
 
558 aa  143  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.22 
 
 
692 aa  143  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.49 
 
 
567 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  27.8 
 
 
568 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  27.59 
 
 
568 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  21.97 
 
 
508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.61 
 
 
561 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  26.59 
 
 
551 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  26.59 
 
 
551 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  29.03 
 
 
599 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.8 
 
 
557 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.15 
 
 
592 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  27.19 
 
 
555 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  25 
 
 
584 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.37 
 
 
581 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.37 
 
 
581 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  23.93 
 
 
597 aa  97.1  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  24.25 
 
 
558 aa  97.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.84 
 
 
585 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.11 
 
 
546 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.83 
 
 
559 aa  94  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.95 
 
 
692 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.4 
 
 
554 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.62 
 
 
549 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  25.09 
 
 
588 aa  91.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.2 
 
 
561 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.2 
 
 
561 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  25.16 
 
 
557 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.75 
 
 
561 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.55 
 
 
553 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  24.83 
 
 
559 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  24.83 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  24.83 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  24.77 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  24.83 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  24.77 
 
 
551 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  23.83 
 
 
559 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  26.34 
 
 
558 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  23.44 
 
 
597 aa  87.8  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.65 
 
 
585 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  25.86 
 
 
562 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  26.08 
 
 
565 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.34 
 
 
579 aa  87  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  26.6 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.98 
 
 
607 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  28.25 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  29.53 
 
 
569 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  23.33 
 
 
595 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.14 
 
 
568 aa  83.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  26.62 
 
 
587 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.73 
 
 
562 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.41 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.69 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  27.08 
 
 
562 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  27.08 
 
 
562 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  22.22 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  22.08 
 
 
565 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.73 
 
 
562 aa  81.3  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.89 
 
 
1349 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.65 
 
 
554 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.37 
 
 
560 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.66 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.81 
 
 
548 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.56 
 
 
561 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.09 
 
 
1570 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>