48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  296  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  95.21 
 
 
146 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  58.39 
 
 
177 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  57.05 
 
 
174 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  59.86 
 
 
182 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  53.02 
 
 
175 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  42.58 
 
 
181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  47.45 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  36.99 
 
 
184 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  37.79 
 
 
206 aa  103  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  42.07 
 
 
165 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  42.55 
 
 
167 aa  101  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  40.69 
 
 
167 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  41.96 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  37.59 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  38.61 
 
 
178 aa  90.5  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  40.69 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  35.51 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  35.51 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  30.92 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  27.89 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  28.19 
 
 
200 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  29.56 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  31.03 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  28 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  32.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  32.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  32.43 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  32.33 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  31.58 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  29.86 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  30.95 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  29.6 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  31.54 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  32 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  30.28 
 
 
190 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  30.71 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  25.53 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  28.17 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  32.8 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  25.53 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  25.53 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  27.01 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  27.19 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  28.47 
 
 
178 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  31.68 
 
 
181 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  31.25 
 
 
245 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>