More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_57760 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  100 
 
 
389 aa  779  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  98.71 
 
 
389 aa  770  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  75.84 
 
 
386 aa  605  1e-172  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  75.84 
 
 
402 aa  607  1e-172  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  81.38 
 
 
380 aa  601  1e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  75.58 
 
 
385 aa  603  1e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  75.06 
 
 
386 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  76.2 
 
 
386 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  77.27 
 
 
386 aa  575  1e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  76.2 
 
 
386 aa  567  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  75.13 
 
 
383 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.11 
 
 
412 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  57.58 
 
 
385 aa  408  1e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  52.84 
 
 
407 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  52.91 
 
 
402 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  52.91 
 
 
402 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  52.91 
 
 
402 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  52.91 
 
 
402 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  52.97 
 
 
407 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.11 
 
 
398 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  52.91 
 
 
402 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  53.63 
 
 
387 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  52.53 
 
 
403 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  53.37 
 
 
388 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.23 
 
 
408 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.26 
 
 
401 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.26 
 
 
401 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  53.26 
 
 
401 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.99 
 
 
401 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.26 
 
 
401 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  53.26 
 
 
401 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  53.18 
 
 
404 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  51.01 
 
 
403 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  53.11 
 
 
388 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  53.99 
 
 
398 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  53.18 
 
 
404 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  53.12 
 
 
402 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  54.19 
 
 
396 aa  371  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  52.83 
 
 
383 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.95 
 
 
396 aa  361  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.65 
 
 
417 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.23 
 
 
398 aa  358  7e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.46 
 
 
383 aa  355  8e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  55.26 
 
 
392 aa  355  9e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 
390 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  51.21 
 
 
372 aa  346  5e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.62 
 
 
379 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  50.13 
 
 
443 aa  337  2e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  53.75 
 
 
385 aa  335  8e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.6 
 
 
380 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  53.11 
 
 
386 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  55.23 
 
 
386 aa  330  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  52.46 
 
 
383 aa  326  4e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  51.92 
 
 
379 aa  326  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.63 
 
 
385 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.83 
 
 
388 aa  319  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.57 
 
 
384 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  47.89 
 
 
384 aa  313  2e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.6 
 
 
513 aa  313  2e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.11 
 
 
442 aa  311  9e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  46.49 
 
 
442 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  4.78038e-13  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  47.55 
 
 
465 aa  303  3e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  51.06 
 
 
496 aa  296  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  47.09 
 
 
472 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  52.04 
 
 
468 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  49.57 
 
 
464 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  49.35 
 
 
350 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  50.47 
 
 
460 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  49.37 
 
 
471 aa  286  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  45.71 
 
 
472 aa  285  7e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  50.31 
 
 
463 aa  285  1e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.95 
 
 
476 aa  285  1e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  49.11 
 
 
464 aa  283  4e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  50.77 
 
 
467 aa  283  5e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  44.24 
 
 
461 aa  282  6e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  47.35 
 
 
457 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  49.54 
 
 
463 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  46.83 
 
 
393 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 
391 aa  279  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  44.96 
 
 
477 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  44.07 
 
 
474 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  41.46 
 
 
502 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  44.07 
 
 
474 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  45.32 
 
 
492 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  48.43 
 
 
458 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  44.67 
 
 
479 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  44.67 
 
 
477 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.52 
 
 
491 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  45.95 
 
 
474 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  45.56 
 
 
491 aa  276  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  46.25 
 
 
474 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.18 
 
 
387 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  45.1 
 
 
502 aa  273  4e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.01531e-09  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  44.64 
 
 
474 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.22 
 
 
464 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  45.24 
 
 
471 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.23 
 
 
479 aa  269  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  45.57 
 
 
511 aa  269  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.4 
 
 
476 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  45.67 
 
 
485 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>