More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_57630 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  98.66 
 
 		 332 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  79.6 
 
 		 335 aa  517  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  79.05 
 
 		 331 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  76.77 
 
 		 334 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  78.57 
 
 		 336 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  77.1 
 
 		 334 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  76.43 
 
 		 334 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  76.43 
 
 		 306 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  77.89 
 
 		 334 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  38.43 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  36.39 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  33.8 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  37.2 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  35.69 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  34.6 
 
 		 360 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.07 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.61 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 330 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.97 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.66 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.1 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  36.44 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.27 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  31.28 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.28 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  33.07 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  31.42 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  30.66 
 
 		 329 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  30.45 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 347 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  32.04 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  32.47 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  29.21 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  30.28 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.27 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.47 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  29.23 
 
 		 320 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  29.58 
 
 		 324 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 437 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  29.23 
 
 		 320 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  28.67 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  28.87 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>