37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56190 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  276  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  92.14 
 
 
140 aa  254  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  50.36 
 
 
140 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  34.35 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  27.42 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  41.18 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  33.08 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  50 
 
 
217 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  31.9 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  31.72 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  27.97 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  47.83 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  47.83 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  40.74 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  40.74 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  40.74 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  40.74 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  30.15 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  30.15 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.182831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  45.65 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  25.69 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  48.84 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  37.21 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  56.67 
 
 
230 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  29.45 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  53.12 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  28.45 
 
 
156 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  29.93 
 
 
181 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  51.52 
 
 
194 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  25.86 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  39.13 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  41.67 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  38.1 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0258  hypothetical protein  34 
 
 
272 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
501 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>