More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55180 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  100 
 
 
299 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  93.98 
 
 
300 aa  587  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.86 
 
 
294 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  64.26 
 
 
294 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  57.5 
 
 
330 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.03 
 
 
294 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
296 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  36.97 
 
 
294 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
300 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
398 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
374 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
727 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
283 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.75 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
663 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
322 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 
672 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
1035 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
1250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
337 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
334 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
320 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
363 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
313 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.83 
 
 
312 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
347 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
361 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
230 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
351 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
327 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
812 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
347 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
299 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
390 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
365 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
324 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
233 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
308 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
303 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
336 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 
367 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
353 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
544 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
277 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
326 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
300 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
367 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
338 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
373 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  31.14 
 
 
316 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
280 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.14 
 
 
266 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 
390 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
349 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
397 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  44.17 
 
 
326 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
314 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
330 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
253 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 
266 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
349 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
297 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
373 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.68 
 
 
266 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 
573 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  29.68 
 
 
266 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
1177 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
357 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
302 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.68 
 
 
266 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14251  hypothetical protein  30.94 
 
 
218 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.485314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
1177 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.73 
 
 
377 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
344 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.97 
 
 
351 aa  99  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
327 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
1067 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
335 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
366 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
386 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>