84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54230 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  87.03 
 
 		 250 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.69 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.9 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  25.49 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  23.44 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  27.56 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  25.5 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  30.65 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  26.56 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  23.46 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  25.53 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.83 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  23.97 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  32.52 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.18 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  26.8 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  22.51 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  22.71 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  22.71 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  22.71 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  22.93 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  27.64 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  27.57 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  24.63 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  30.43 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  26.24 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.52 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  22 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30.52 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  22.22 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.54 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  27.98 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.83 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  23.39 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.83 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.83 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.83 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.97 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.83 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.83 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.83 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  23 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.66 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.52 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3862  hypothetical protein  22.35 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  25.99 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  24.89 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.45 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  21.94 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.24 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.53 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  26.22 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  25.35 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.92 
 
 		 244 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.35 
 
 		 320 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.35 
 
 		 315 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>