More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  100 
 
 
394 aa  800  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  98.22 
 
 
394 aa  788  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  74.11 
 
 
395 aa  607  1e-172  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  78.43 
 
 
394 aa  603  1e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  74.18 
 
 
399 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  52.39 
 
 
413 aa  417  1e-115  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  50.75 
 
 
399 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  49.5 
 
 
399 aa  398  1e-110  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  49.5 
 
 
400 aa  400  1e-110  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  49.5 
 
 
399 aa  398  1e-110  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.76936e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  49.5 
 
 
399 aa  398  1e-110  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  56.36 
 
 
395 aa  399  1e-110  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  49.5 
 
 
399 aa  398  1e-110  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  49.5 
 
 
399 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  50.13 
 
 
398 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  5.57586e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  48.87 
 
 
399 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  48.87 
 
 
399 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  49.62 
 
 
398 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  52.44 
 
 
410 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0346  acetate kinase  51.89 
 
 
400 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657885  hitchhiker  3.56853e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  48.61 
 
 
399 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  48.61 
 
 
399 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  49.87 
 
 
398 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  48.11 
 
 
400 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  51.67 
 
 
410 aa  390  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  49.87 
 
 
398 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  50.65 
 
 
393 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  50.51 
 
 
398 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  48.36 
 
 
404 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  54.01 
 
 
401 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  50.38 
 
 
412 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  51.42 
 
 
403 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  52.7 
 
 
449 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  49.25 
 
 
398 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  46.29 
 
 
398 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  46.73 
 
 
397 aa  357  1e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  53.47 
 
 
405 aa  358  1e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  48.31 
 
 
415 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  48.63 
 
 
402 aa  354  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  47.21 
 
 
398 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  47.79 
 
 
425 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  46.23 
 
 
421 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  47.79 
 
 
425 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  47.87 
 
 
398 aa  350  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  48.35 
 
 
400 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  48.72 
 
 
406 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  48.72 
 
 
402 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02933  hypothetical protein  48.72 
 
 
406 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  48.72 
 
 
402 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0856  acetate kinase  49.88 
 
 
409 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00408014  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  47.85 
 
 
398 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  47.37 
 
 
398 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  47.87 
 
 
400 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  48.46 
 
 
402 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  48.37 
 
 
402 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  48.21 
 
 
411 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  48.46 
 
 
402 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  48.46 
 
 
402 aa  346  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  48.46 
 
 
402 aa  345  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  47.95 
 
 
402 aa  345  7e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  43.64 
 
 
406 aa  345  8e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  46.84 
 
 
400 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  43.32 
 
 
401 aa  343  3e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  43.22 
 
 
403 aa  343  3e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  43.32 
 
 
403 aa  343  4e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  47.86 
 
 
422 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  43.97 
 
 
406 aa  342  6e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  45.41 
 
 
396 aa  342  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  45.2 
 
 
398 aa  342  8e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  47.87 
 
 
400 aa  342  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  42.32 
 
 
399 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.13101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  48.34 
 
 
402 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  46.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  43.97 
 
 
402 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  44.72 
 
 
397 aa  341  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  44.47 
 
 
397 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  50 
 
 
414 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3537  propionate/acetate kinase  47.95 
 
 
402 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.831906  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3433  propionate/acetate kinase  47.95 
 
 
402 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  45.82 
 
 
400 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  45.82 
 
 
400 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3600  propionate/acetate kinase  47.95 
 
 
402 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  51.15 
 
 
408 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  50 
 
 
414 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  42.86 
 
 
404 aa  339  5e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3504  propionate/acetate kinase  47.95 
 
 
402 aa  339  6e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3430  propionate/acetate kinase  47.95 
 
 
402 aa  339  6e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>