More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53190 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  100 
 
 
101 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  96.04 
 
 
101 aa  204  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  70.71 
 
 
99 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  72.92 
 
 
97 aa  150  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  72.34 
 
 
95 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  70.83 
 
 
102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  71.88 
 
 
97 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  66.67 
 
 
99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  67.71 
 
 
98 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  67.71 
 
 
98 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  66.67 
 
 
98 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  58.25 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  51.52 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  50 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  54.9 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  53 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  50.51 
 
 
104 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  43.12 
 
 
110 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  47.62 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  45.63 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  43 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  43 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  43 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  46.46 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  46.46 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  45.1 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  45.54 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  46.53 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  46.53 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  46.53 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  46.53 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  46.53 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  46.53 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  46.53 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  46.53 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  41.9 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  46.46 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  47.57 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  42 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  45.56 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  45.98 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  42 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  41 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  46.15 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  43.82 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  45.05 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  47.25 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  47.25 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  44.12 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  44.44 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  47.13 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  47.25 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  41.67 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  47.25 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  42.42 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  46.15 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  47.13 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  43.53 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  40.4 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  44.83 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  42.39 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  45.35 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  41.12 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  39.25 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  47.54 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  47.54 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  49.15 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  41.67 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  48.33 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  46.58 
 
 
83 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  42.67 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  40 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  53.85 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  42.17 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  42.05 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  40.7 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  37.5 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  47.46 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  42.53 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  42.53 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  50 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  48.98 
 
 
88 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  46.55 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  38.46 
 
 
84 aa  57.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  45 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  42.86 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  45.76 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  49.02 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  41.43 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14849  predicted protein  40 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  39.53 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  41.43 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  41.43 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0323128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>