More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  86.31 
 
 
480 aa  847    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  85.68 
 
 
480 aa  836    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  86.31 
 
 
480 aa  838    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  66.46 
 
 
480 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  86.31 
 
 
480 aa  847    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  87.76 
 
 
480 aa  858    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  86.31 
 
 
480 aa  847    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  85.68 
 
 
480 aa  796    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  67.51 
 
 
479 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  100 
 
 
482 aa  966    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  89 
 
 
480 aa  865    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  100 
 
 
482 aa  966    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  86.72 
 
 
480 aa  847    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  64.69 
 
 
494 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  63.58 
 
 
478 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  56.94 
 
 
481 aa  545  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  54.56 
 
 
491 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  55.19 
 
 
481 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  54.56 
 
 
491 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  54.56 
 
 
491 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  53.85 
 
 
477 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  53.72 
 
 
478 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  54.57 
 
 
492 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  54.89 
 
 
492 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  46.9 
 
 
453 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  47.97 
 
 
422 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  45.13 
 
 
453 aa  359  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  47.32 
 
 
452 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  43.18 
 
 
450 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  41.37 
 
 
450 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  42.49 
 
 
452 aa  343  5e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  43.09 
 
 
453 aa  340  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  41.72 
 
 
451 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  42.47 
 
 
453 aa  335  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  40.14 
 
 
453 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  40.13 
 
 
452 aa  332  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  40.53 
 
 
454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  42.29 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  40.09 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  40.49 
 
 
454 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  40.49 
 
 
454 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  40.49 
 
 
454 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  41.36 
 
 
454 aa  323  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  39.65 
 
 
454 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  39.43 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  40.14 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  38.99 
 
 
455 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  39.65 
 
 
454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  39.43 
 
 
454 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  39.6 
 
 
451 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  37.64 
 
 
454 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  37.64 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  37.61 
 
 
452 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  38.88 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  41.33 
 
 
455 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  38.19 
 
 
454 aa  299  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
446 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.23 
 
 
475 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  38.84 
 
 
471 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  37.36 
 
 
443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  40.33 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  38.64 
 
 
471 aa  282  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  37.7 
 
 
492 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  35.55 
 
 
456 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  39.05 
 
 
445 aa  277  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  35.55 
 
 
456 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.83 
 
 
484 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  37.47 
 
 
481 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  35.31 
 
 
456 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  35.73 
 
 
445 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  37.47 
 
 
471 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  35.07 
 
 
456 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  35.35 
 
 
473 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  35.39 
 
 
445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  38.12 
 
 
471 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  38.89 
 
 
462 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  37.65 
 
 
471 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  36.75 
 
 
476 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  38.36 
 
 
453 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  35.78 
 
 
458 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  35.07 
 
 
456 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  35.07 
 
 
456 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  35.07 
 
 
456 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  35.07 
 
 
456 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  36 
 
 
473 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  35.46 
 
 
465 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  35.07 
 
 
454 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  37.53 
 
 
461 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  35.45 
 
 
459 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  35.45 
 
 
444 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  35.24 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  37.47 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  34.67 
 
 
445 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  32.57 
 
 
455 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  33.11 
 
 
448 aa  253  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  36.26 
 
 
479 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  33.33 
 
 
450 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  35.31 
 
 
481 aa  250  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  33.79 
 
 
442 aa  249  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  36.13 
 
 
482 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>