84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  90.37 
 
 
135 aa  259  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  54.69 
 
 
134 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  55.56 
 
 
134 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  56 
 
 
134 aa  160  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  55.08 
 
 
143 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  53.12 
 
 
134 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  50 
 
 
135 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  55.56 
 
 
132 aa  146  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  48.41 
 
 
135 aa  143  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  30.43 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.57 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.57 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.57 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  31.62 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  33.98 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.03 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.55 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  42.47 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.55 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.55 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.55 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  31.85 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  34.34 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.28 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  27.94 
 
 
157 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.17 
 
 
279 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.65 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.58 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.04 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  25.81 
 
 
138 aa  60.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.84 
 
 
351 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.95 
 
 
267 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  29.1 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.56 
 
 
263 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.09 
 
 
325 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.15 
 
 
251 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.15 
 
 
251 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.95 
 
 
241 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.52 
 
 
397 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.69 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  39.73 
 
 
281 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.88 
 
 
283 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.07 
 
 
524 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.47 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.62 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  31.94 
 
 
297 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  42.11 
 
 
305 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
279 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.8 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.29 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0760  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.17 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.65 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.7 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  25.71 
 
 
274 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.29 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  27.91 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.23 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0915  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.63 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  30.56 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.65 
 
 
278 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.63 
 
 
167 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.63 
 
 
167 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.86 
 
 
234 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.78 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0388  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.67 
 
 
242 aa  43.9  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.04 
 
 
282 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.04 
 
 
266 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  34.18 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.89 
 
 
365 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0424  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.36269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.48 
 
 
335 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.68 
 
 
242 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  38.46 
 
 
478 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.81 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.46 
 
 
478 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.59 
 
 
284 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  35 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  31.58 
 
 
147 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>