More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  96.11 
 
 		 411 aa  778    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  100 
 
 		 411 aa  833    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  66.08 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  65.92 
 
 		 405 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  41.34 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  37.68 
 
 		 412 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  37.44 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  43.4 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  36.18 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  35.31 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  44.4 
 
 		 310 aa  229  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  34.89 
 
 		 525 aa  229  9e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  35.16 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  46.83 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  46.83 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  47.22 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  38.75 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  42.58 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  46.22 
 
 		 295 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  43.96 
 
 		 297 aa  222  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  43.65 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  38.69 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  33.33 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  44.72 
 
 		 285 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  41.98 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  46.43 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  44.44 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  44.44 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  44.44 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  44.44 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  42.41 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  36.04 
 
 		 444 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  43.45 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  36.22 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  43.02 
 
 		 314 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  37.94 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  39.03 
 
 		 296 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  36.19 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  41.63 
 
 		 313 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  43.02 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  38.35 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  38.35 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  38.35 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  38.35 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  38.35 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  37.83 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  42.86 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  37.76 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  37.76 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  39.41 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  42.86 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  44.84 
 
 		 294 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  42.86 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  38.64 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  41.06 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  38.35 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  38.35 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  38.81 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 290 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 290 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  38.81 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 290 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  38.81 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  40.3 
 
 		 437 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 290 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 290 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  34.08 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  35.33 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  35.34 
 
 		 443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  39.93 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  33.06 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  34.79 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 290 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  44.24 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  32.58 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  38.58 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  35.8 
 
 		 292 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  42.47 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  37.3 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  32.11 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  32.29 
 
 		 422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  31.27 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  42.08 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  38.03 
 
 		 417 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  41.18 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  38.72 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  38.87 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  38.4 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  38.4 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  39.47 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  29.47 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>