230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.28207e-08  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  97.81 
 
 
274 aa  444  1e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  71.27 
 
 
268 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  70.91 
 
 
268 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  72.59 
 
 
268 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  69.42 
 
 
271 aa  335  6e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  70.55 
 
 
272 aa  327  1e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  76.89 
 
 
248 aa  327  2e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  70.98 
 
 
270 aa  319  2e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  67.15 
 
 
273 aa  305  8e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  66.8 
 
 
279 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  33.02 
 
 
322 aa  139  5e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  37.02 
 
 
262 aa  138  9e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  32.59 
 
 
322 aa  137  3e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  33.46 
 
 
254 aa  130  2e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  33.2 
 
 
271 aa  127  1e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  39.9 
 
 
258 aa  127  1e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  5.38849e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  32.43 
 
 
271 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  38.46 
 
 
268 aa  121  1e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  33.76 
 
 
285 aa  116  4e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  38.69 
 
 
263 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.73622e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  38.69 
 
 
263 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.23566e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  38.69 
 
 
263 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.22433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  38.69 
 
 
263 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  6.12768e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  38.69 
 
 
263 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.29093e-08  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  38.69 
 
 
263 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  38.19 
 
 
263 aa  114  2e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.28041e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  38.19 
 
 
263 aa  114  2e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.35641e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  34.76 
 
 
243 aa  113  4e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  37.69 
 
 
263 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  35.82 
 
 
264 aa  112  8e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  2.29086e-08  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  36.36 
 
 
262 aa  111  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.80184e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  36.36 
 
 
262 aa  111  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  37.69 
 
 
262 aa  110  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  37.69 
 
 
262 aa  110  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  6.91126e-05  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  33.98 
 
 
254 aa  108  9e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.61839e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 
255 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  32.67 
 
 
263 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  36.04 
 
 
258 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  2.995e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
257 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  31.8 
 
 
251 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
240 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.57088e-08  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  29.86 
 
 
300 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  29.72 
 
 
305 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  32.38 
 
 
265 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  34.12 
 
 
254 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.10917e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  37.19 
 
 
262 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.19726e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  30.45 
 
 
261 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.08782e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  36.36 
 
 
258 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.56344e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  35.61 
 
 
188 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  32.86 
 
 
284 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 
269 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.1862e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 
242 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.36736e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  31.63 
 
 
245 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.3069e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2527  hypothetical protein  35.44 
 
 
255 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000191168  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  32.52 
 
 
261 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
252 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  32.52 
 
 
261 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 
269 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  34.11 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.29972e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  33.94 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  34.47 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.06098e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  34.47 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  6.55346e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  34.47 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  31.55 
 
 
274 aa  99  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  32.02 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  33.95 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  6.16267e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  34.12 
 
 
249 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.24758e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
249 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.56054e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  34.12 
 
 
249 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.01827e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  34.12 
 
 
249 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.11459e-10  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  33.5 
 
 
243 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.99161e-08  hitchhiker  2.35132e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  34.87 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.95525e-10  decreased coverage  4.50337e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  33.02 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  34.55 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  41.53 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.43705e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  30 
 
 
304 aa  92  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.3 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  31.22 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  31.56 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  31.28 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.04047e-08  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  34.12 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.67584e-06  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  34.12 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.82291e-09  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 
249 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  31.84 
 
 
279 aa  85.1  1e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  28.64 
 
 
249 aa  84.7  1e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  29.13 
 
 
249 aa  85.1  1e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  28.64 
 
 
252 aa  85.5  1e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
264 aa  84  2e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 
321 aa  84  2e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 
249 aa  83.6  3e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 
249 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 
249 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  28.16 
 
 
249 aa  83.6  3e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  29.72 
 
 
274 aa  83.6  3e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.23403e-08  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
249 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>