More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51190 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_51190  thiolase  100 
 
 
383 aa  777    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  94.78 
 
 
383 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  68.32 
 
 
385 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  64.34 
 
 
390 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  62.4 
 
 
383 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  63.12 
 
 
402 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  63.21 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  63.12 
 
 
402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  62.08 
 
 
403 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  60.05 
 
 
385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  58.47 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  58.76 
 
 
390 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  59.89 
 
 
381 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  56.84 
 
 
384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  54.74 
 
 
390 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  50.96 
 
 
389 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  50.53 
 
 
381 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.31 
 
 
382 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  47.87 
 
 
382 aa  316  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  47.24 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  48.15 
 
 
384 aa  296  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  42.31 
 
 
380 aa  285  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  43.86 
 
 
388 aa  282  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  41.8 
 
 
379 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  41.95 
 
 
379 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  41.27 
 
 
379 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  42.03 
 
 
379 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.97 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  41.01 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  42.52 
 
 
391 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  41.73 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.51 
 
 
380 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  41.64 
 
 
389 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  39.68 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  40.51 
 
 
391 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 
389 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  40.11 
 
 
390 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  43.49 
 
 
383 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  42.05 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  40.32 
 
 
388 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  41.51 
 
 
382 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
382 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  39.15 
 
 
388 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  40.48 
 
 
385 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  42.33 
 
 
387 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  41.24 
 
 
382 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.47 
 
 
381 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.95 
 
 
389 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  41.04 
 
 
389 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.21 
 
 
388 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  38.93 
 
 
393 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  39.33 
 
 
395 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.62 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  39.33 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  36.44 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.44 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.82 
 
 
387 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  36.32 
 
 
395 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  35.14 
 
 
396 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 
386 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.56 
 
 
384 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.27 
 
 
387 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.8 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.58 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  35.6 
 
 
404 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.54 
 
 
385 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.64 
 
 
388 aa  182  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.42 
 
 
386 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  34.48 
 
 
404 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.38 
 
 
387 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.38 
 
 
388 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.79 
 
 
378 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  33.33 
 
 
406 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  35.9 
 
 
383 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.98 
 
 
548 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.34 
 
 
394 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.39 
 
 
550 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.08 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.48 
 
 
550 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.39 
 
 
550 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  35.64 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.54 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  36.6 
 
 
396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  34.88 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36 
 
 
548 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  31.9 
 
 
380 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  33.33 
 
 
397 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.23 
 
 
385 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.97 
 
 
390 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.51 
 
 
541 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  35.04 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  35.54 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.81 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  32.17 
 
 
402 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  30.54 
 
 
392 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  33.07 
 
 
388 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>