More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50670 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  97.34 
 
 		 301 aa  554  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  71.73 
 
 		 301 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  49.48 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.38 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  50 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  46.71 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.57 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.84 
 
 		 330 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.49 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  43.29 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.07 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.58 
 
 		 355 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  42.65 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  42.86 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  32.44 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.72 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.6 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.6 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  26.22 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  32.3 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.74 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  26.16 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.89 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  29.68 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  32.87 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  29 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.86 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.87 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.41 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  27.11 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.82 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.46 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.61 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.82 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  31.93 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  25 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30.8 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  25.99 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  28.8 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  30.18 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.77 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.41 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  29.29 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  28.46 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.12 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  28.83 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  30.11 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  30.48 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.95 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  26.28 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  29.51 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  26.6 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.75 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.45 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  25.27 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.45 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.45 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.55 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.45 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  27.67 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.09 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  25.8 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.33 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.11 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.11 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  26.69 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  31.8 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.55 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.26 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  29.92 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  28.94 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.58 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>