105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  63.64 
 
 
220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  44.86 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  44.34 
 
 
219 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  36.95 
 
 
208 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1018  hypothetical protein  33.49 
 
 
212 aa  89  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.65 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  31.97 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  34.69 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  30.82 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  34.75 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  34.42 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  33.88 
 
 
256 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  34.43 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  33.33 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  28.87 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  28.87 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  28.34 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  33.63 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  30.71 
 
 
590 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  37.5 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  37.5 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  35.14 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  38.93 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  30.71 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  37.5 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  37.5 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  37.5 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  37.5 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  35.09 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  31.89 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  31.89 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  31.53 
 
 
522 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
253 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  30.11 
 
 
253 aa  48.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  32.71 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  27.93 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  41.11 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  27.94 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
428 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.81 
 
 
244 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  35.42 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  30.91 
 
 
388 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  35.42 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  34.55 
 
 
256 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  35.42 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  35.42 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  35.42 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  35.42 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06371  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.23 
 
 
449 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  28.38 
 
 
630 aa  45.8  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1239  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0490537  hitchhiker  0.0000000000806727 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  29.38 
 
 
388 aa  45.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  36.9 
 
 
230 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  31.54 
 
 
256 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  28.28 
 
 
222 aa  45.1  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  27.22 
 
 
228 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  26.19 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.35 
 
 
262 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  36.67 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  24.32 
 
 
818 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  27.47 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  32.38 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  32.46 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2927  nucleotidyl transferase  27.41 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.612838  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  44.64 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3125  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.520592  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  25.14 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3134  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  30.93 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3277  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
263 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.576784  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  32.43 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1802  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.37 
 
 
452 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.27 
 
 
592 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3368  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  44.26 
 
 
460 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  27.1 
 
 
616 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  25.23 
 
 
411 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  25.23 
 
 
411 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0911  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  26.54 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0718  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  37.66 
 
 
460 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.352901  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  26.89 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  42.62 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  30.58 
 
 
589 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  30.09 
 
 
595 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0867  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
381 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1117  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  37.7 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0133813  normal  0.923031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1188  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  37.7 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.340354  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1118  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  37.7 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  26.92 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  32.76 
 
 
436 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  27.39 
 
 
232 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06761  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.93 
 
 
447 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  35.79 
 
 
270 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  25 
 
 
263 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  25.23 
 
 
411 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>