218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50300 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.32 
 
 
1191 aa  695    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  44.98 
 
 
1190 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
1198 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  45.55 
 
 
1177 aa  715    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  46.48 
 
 
1165 aa  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  100 
 
 
1694 aa  3370    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 
1187 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  44.68 
 
 
1359 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  47.02 
 
 
1759 aa  1347    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  46.48 
 
 
1165 aa  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  44.76 
 
 
1188 aa  694    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  42.84 
 
 
1192 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  49.89 
 
 
1171 aa  745    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  44.77 
 
 
1193 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 
1162 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.62 
 
 
1173 aa  457  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  36.06 
 
 
1213 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
968 aa  270  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.32 
 
 
968 aa  260  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
974 aa  251  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
765 aa  227  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
1275 aa  224  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
958 aa  221  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
632 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
733 aa  221  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28.54 
 
 
731 aa  211  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
709 aa  210  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
709 aa  210  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
602 aa  208  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
965 aa  207  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 
625 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 
625 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
1509 aa  198  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
734 aa  197  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
746 aa  197  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
832 aa  196  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
1991 aa  196  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
723 aa  189  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
625 aa  189  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
1486 aa  188  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
728 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
721 aa  181  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.85 
 
 
610 aa  180  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
717 aa  179  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
717 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
1561 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  22.98 
 
 
1152 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
684 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
710 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
1152 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 
658 aa  174  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
880 aa  174  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
653 aa  172  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  32.36 
 
 
652 aa  172  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
1334 aa  171  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
988 aa  170  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  27.44 
 
 
810 aa  169  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
794 aa  167  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
775 aa  165  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
983 aa  165  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 
670 aa  164  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
635 aa  162  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
2046 aa  162  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
551 aa  162  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  31.77 
 
 
551 aa  162  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
684 aa  160  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  33.41 
 
 
556 aa  159  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  27.55 
 
 
1182 aa  159  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
1067 aa  158  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
732 aa  158  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
662 aa  154  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
526 aa  154  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
555 aa  153  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
539 aa  153  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
996 aa  152  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
531 aa  152  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
725 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
1297 aa  149  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  27.79 
 
 
725 aa  147  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
617 aa  144  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
729 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  23.85 
 
 
783 aa  143  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  26.08 
 
 
742 aa  143  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
783 aa  142  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 
742 aa  139  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
576 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
808 aa  136  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
857 aa  135  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
796 aa  133  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
586 aa  133  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
742 aa  133  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
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NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  29.86 
 
 
905 aa  132  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.559988 
 
 
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NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.65 
 
 
809 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
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NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
958 aa  129  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
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NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  25.82 
 
 
1644 aa  129  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  25.82 
 
 
1644 aa  129  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.38 
 
 
632 aa  128  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
1084 aa  126  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
784 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  22.7 
 
 
790 aa  109  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
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