More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  100 
 
 
488 aa  933  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  53.51 
 
 
483 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  52.13 
 
 
492 aa  407  1e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  49.8 
 
 
484 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  49.6 
 
 
485 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  46.86 
 
 
492 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  47.08 
 
 
482 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  47.48 
 
 
481 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  47.06 
 
 
467 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  46.96 
 
 
516 aa  360  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  46.45 
 
 
468 aa  358  1e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  46.58 
 
 
517 aa  356  7e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  46.58 
 
 
493 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  45.29 
 
 
501 aa  327  2e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  43.56 
 
 
475 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  43 
 
 
475 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  43.74 
 
 
494 aa  322  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  42.47 
 
 
497 aa  315  1e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  44.98 
 
 
490 aa  312  8e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  44.58 
 
 
492 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  43.98 
 
 
492 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  42.83 
 
 
506 aa  308  1e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  41.24 
 
 
498 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  40.04 
 
 
493 aa  285  1e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  1.74414e-05 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  40.04 
 
 
493 aa  285  1e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  43.18 
 
 
471 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  40.59 
 
 
486 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  40.6 
 
 
488 aa  275  9e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  42.42 
 
 
472 aa  274  2e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  40.29 
 
 
395 aa  266  6e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  68.12 
 
 
387 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  37.55 
 
 
492 aa  259  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  37 
 
 
580 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  36.92 
 
 
469 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  40.83 
 
 
462 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  39.64 
 
 
431 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  38.7 
 
 
506 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  61.19 
 
 
394 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  61.19 
 
 
393 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  37.86 
 
 
502 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.96793e-08 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  38.31 
 
 
493 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  38.31 
 
 
506 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  38.31 
 
 
506 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  41.29 
 
 
687 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  36.31 
 
 
420 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  46.15 
 
 
375 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  49.15 
 
 
377 aa  214  4e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  48.95 
 
 
378 aa  213  5e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  34.65 
 
 
502 aa  213  6e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  63.98 
 
 
379 aa  213  6e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  58.89 
 
 
377 aa  213  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  50.21 
 
 
402 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  35.26 
 
 
505 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  60.95 
 
 
378 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  63.35 
 
 
377 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  49.8 
 
 
294 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  43.58 
 
 
609 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  63.35 
 
 
379 aa  204  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  59.63 
 
 
384 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  49.78 
 
 
377 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  59.63 
 
 
376 aa  202  1e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  50 
 
 
377 aa  202  1e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  50 
 
 
377 aa  202  1e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  35.03 
 
 
498 aa  201  2e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  58.9 
 
 
377 aa  201  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  59.51 
 
 
377 aa  201  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  43.57 
 
 
376 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  49.59 
 
 
319 aa  199  8e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
271 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
271 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  49.35 
 
 
377 aa  199  1e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  57.76 
 
 
384 aa  197  4e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  58.38 
 
 
276 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  54.9 
 
 
388 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  58.24 
 
 
272 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  58.24 
 
 
272 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  47.06 
 
 
294 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  55.21 
 
 
282 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  55.74 
 
 
271 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  55.74 
 
 
271 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
271 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
271 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  58.82 
 
 
404 aa  191  3e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  59.01 
 
 
376 aa  191  3e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  43.88 
 
 
385 aa  190  6e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  57.4 
 
 
270 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  55.15 
 
 
276 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  63.35 
 
 
274 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  47.15 
 
 
319 aa  185  1e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  56.47 
 
 
274 aa  184  2e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  54.15 
 
 
280 aa  184  4e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  54.12 
 
 
275 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  55.49 
 
 
405 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  55.88 
 
 
274 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  32.65 
 
 
387 aa  182  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  38.41 
 
 
587 aa  181  3e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  53.53 
 
 
275 aa  181  3e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  32.13 
 
 
481 aa  180  6e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  51.31 
 
 
282 aa  180  6e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  55.88 
 
 
272 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>