244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48750 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  276  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  93.33 
 
 
135 aa  261  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  56.1 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  48.87 
 
 
132 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  49.62 
 
 
132 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  48.12 
 
 
132 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  48.87 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  48.87 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  48.87 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  48.87 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  48.87 
 
 
130 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  48.87 
 
 
130 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  48.87 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  44.2 
 
 
415 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  43.61 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  40.14 
 
 
410 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  48.41 
 
 
135 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  45.6 
 
 
406 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  45.32 
 
 
413 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  40.46 
 
 
402 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  46.67 
 
 
407 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  38.73 
 
 
410 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  44.72 
 
 
129 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  38.24 
 
 
406 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  43.7 
 
 
153 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  41.13 
 
 
406 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  45.38 
 
 
411 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  43.59 
 
 
405 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  41.13 
 
 
412 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  44.92 
 
 
423 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  37.98 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  42.62 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  40.14 
 
 
409 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  41.88 
 
 
409 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  39.53 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  41.38 
 
 
410 aa  94.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  38.76 
 
 
418 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  37.31 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  42.61 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  34.03 
 
 
405 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  39.23 
 
 
127 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  39.66 
 
 
405 aa  89.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  40.98 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  35.82 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  37.5 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  36.84 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  41.44 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  36.52 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  36.52 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  37.98 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  37.4 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  37.21 
 
 
408 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  36.97 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  34.86 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  36.97 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  36.97 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  36.97 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  35.09 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  39.45 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  41.28 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  32.52 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  42.57 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  35.83 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  35.83 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  40.95 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  35.83 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  35.83 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  35.83 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  36.13 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  37.61 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  35.83 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  31.88 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  37.39 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  36.54 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  37.39 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  37.14 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  38.1 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  34.17 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  34.17 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  31.69 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  29.23 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  30 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  31.19 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  26.92 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  26.92 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  41.89 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  30.19 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1564  OsmC family protein  29.73 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.58 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  26.15 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  29.66 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02028  hypothetical protein  43.42 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.326334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32.14 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  29.57 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  29 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  30.69 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  26.72 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  27.42 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  33.77 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  30.11 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>